55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2675 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2675  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  809    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1291  hypothetical protein  60.12 
 
 		 351 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  29.94 
 
 		 418 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  30.03 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  29.94 
 
 		 419 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  29.38 
 
 		 423 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  31.18 
 
 		 304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6409  dienelactone hydrolase-like protein  33.44 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  28.42 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  29.2 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  29.52 
 
 		 423 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  29.52 
 
 		 423 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  30.32 
 
 		 423 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  28.01 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2274  hypothetical protein  29.2 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0414  hypothetical protein  29.2 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0393  hypothetical protein  29.2 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2013  peptidase  29.2 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0575  hypothetical protein  29.2 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3082  hypothetical protein  29.2 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0174  hypothetical protein  28.05 
 
 		 429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  32.39 
 
 		 298 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0112  putative signal peptide protein  30.23 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  31.73 
 
 		 312 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  30.52 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  30.08 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1669  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  31.16 
 
 		 331 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4903  hypothetical protein  26.36 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2524  hypothetical protein  31.13 
 
 		 292 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26540  hypothetical protein  28.85 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  31.16 
 
 		 679 aa  52.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  24.8 
 
 		 256 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  30.32 
 
 		 690 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  29.34 
 
 		 674 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1236  hypothetical protein  33.61 
 
 		 665 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  26.35 
 
 		 677 aa  47.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  23.74 
 
 		 275 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  29.01 
 
 		 677 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  29.25 
 
 		 673 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0404  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.59 
 
 		 607 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  29.7 
 
 		 678 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.61 
 
 		 629 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  36.56 
 
 		 668 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.3 
 
 		 653 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  28.99 
 
 		 667 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.42 
 
 		 642 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1306  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  27.62 
 
 		 651 aa  43.9  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  33.33 
 
 		 670 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.03 
 
 		 683 aa  43.5  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  28.08 
 
 		 634 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 295 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  28.57 
 
 		 674 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 295 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  28.21 
 
 		 667 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  36.89 
 
 		 650 aa  42.7  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>