More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0973 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0973  iron-dicitrate transporter permease subunit  100 
 
 		 331 aa  637    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.667352  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4866  iron-dicitrate transporter permease subunit  75.54 
 
 		 332 aa  447  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04155  iron-dicitrate transporter subunit  75.54 
 
 		 332 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3711  transport system permease protein  75.54 
 
 		 332 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04118  hypothetical protein  75.54 
 
 		 332 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0741  iron-dicitrate transporter permease subunit  75.23 
 
 		 332 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  46.43 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0666  iron-dicitrate transporter permease subunit  44.89 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.978539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0762  iron(III) dicitrate transport system, permease protein FecC  45.2 
 
 		 324 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  39.02 
 
 		 338 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  40.72 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001070  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuC  44.6 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  36.62 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  36.62 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  38.44 
 
 		 332 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  36.63 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  39.81 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  39.1 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  38.65 
 
 		 322 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  39.93 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  39.93 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  36.7 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  38.65 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  39.93 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  39.93 
 
 		 340 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  39.45 
 
 		 329 aa  179  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  39.58 
 
 		 340 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  39.58 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  31.53 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  37.99 
 
 		 333 aa  175  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  38.3 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  40.28 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  36.14 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  37.01 
 
 		 333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  40.28 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  40.57 
 
 		 344 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 		 325 aa  172  5.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  39.58 
 
 		 334 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  41.46 
 
 		 334 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  40.14 
 
 		 330 aa  172  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  36.68 
 
 		 363 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  39.54 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  36.04 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  36.47 
 
 		 363 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  41.39 
 
 		 350 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  41.07 
 
 		 334 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  41.07 
 
 		 334 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  38.41 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  41.07 
 
 		 334 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  41.67 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  39.58 
 
 		 334 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  36.99 
 
 		 328 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  36.99 
 
 		 328 aa  168  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  36.07 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  39.4 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  36.22 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  37.87 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  39.15 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  40 
 
 		 330 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  36.81 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  39.78 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  36.45 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  34.67 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  34.67 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  37.01 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  40.07 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.54 
 
 		 374 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  39.37 
 
 		 372 aa  166  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  40.35 
 
 		 345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 		 338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  33.96 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  38.44 
 
 		 333 aa  165  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 338 aa  165  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.3 
 
 		 644 aa  165  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  38.49 
 
 		 341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.35 
 
 		 678 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  38.52 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  34.28 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  38.95 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  42.65 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  34.28 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  34.28 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  37.72 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  37.72 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  37.72 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  34.28 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  40.4 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  39.07 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 		 351 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  43.73 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  37.5 
 
 		 347 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>