More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4866 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04155  iron-dicitrate transporter subunit  99.7 
 
 		 332 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3711  transport system permease protein  99.7 
 
 		 332 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04118  hypothetical protein  99.7 
 
 		 332 aa  639    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4866  iron-dicitrate transporter permease subunit  100 
 
 		 332 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0741  iron-dicitrate transporter permease subunit  99.4 
 
 		 332 aa  637    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0973  iron-dicitrate transporter permease subunit  75.54 
 
 		 331 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.667352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  46.33 
 
 		 333 aa  276  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  42.81 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  39.07 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0666  iron-dicitrate transporter permease subunit  40.19 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.978539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0762  iron(III) dicitrate transport system, permease protein FecC  40.81 
 
 		 324 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  39.93 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 343 aa  189  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  39.57 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001070  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuC  42.86 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  35.35 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  35.35 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  39.58 
 
 		 332 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  38.89 
 
 		 334 aa  178  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  39.35 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  37.99 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  41.02 
 
 		 350 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  37.63 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  37.63 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  37.28 
 
 		 340 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  37.28 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  40 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  35 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  40.21 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  33.77 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  37.37 
 
 		 351 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  37.37 
 
 		 351 aa  172  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  39.52 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  37.37 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  38.06 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  38.46 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  37.01 
 
 		 351 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  38.35 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  36.65 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  37.01 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  37.01 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  38.35 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  37.01 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  36.65 
 
 		 351 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  37.99 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  32.02 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  36.25 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  40.27 
 
 		 340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  33.33 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  39.07 
 
 		 330 aa  165  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  33.33 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.28 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  38.11 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  39.04 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  39.07 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  32.46 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  35.05 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  37.59 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  39.78 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  37.05 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  39.78 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  39.78 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  36.39 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  38.27 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  42.29 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  39.57 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  38.68 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  40.21 
 
 		 356 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  35.37 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  33.22 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  38.05 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  35.76 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.07 
 
 		 644 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  35.92 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2245  transport system permease protein  33.33 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.148994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2207  transport system permease protein  33.33 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.748712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0795  iron compound ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0863815  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0808  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuB  34.04 
 
 		 337 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  37.25 
 
 		 345 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  35.07 
 
 		 363 aa  159  8e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.74 
 
 		 351 aa  159  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  34.12 
 
 		 325 aa  159  9e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1048  transport system permease protein  36.43 
 
 		 335 aa  158  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  39.6 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  35.05 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2357  iron compound ABC transporter, permease protein  34.66 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  40.86 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  32.4 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  36.63 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  34.52 
 
 		 372 aa  156  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 338 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  33.8 
 
 		 369 aa  156  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  38.93 
 
 		 347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3060  transport system permease protein  40.48 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  34.34 
 
 		 340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  35.86 
 
 		 381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>