239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0832 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0832  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1064  protein of unknown function DUF81  92.52 
 
 		 254 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  46 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  42.45 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  42.17 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  42.17 
 
 		 276 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  41.37 
 
 		 253 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  42.17 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  38.68 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  36.76 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  36.63 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  37.86 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  36.21 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  37.04 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  37.45 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  34.52 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  35.39 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  35.54 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  35.29 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  32.79 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  32.79 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  32.79 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  34.15 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  35.29 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  35.29 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  36.47 
 
 		 255 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  36.08 
 
 		 255 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  36.47 
 
 		 255 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  34.68 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  36.08 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3919  hypothetical protein  36.21 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  35.39 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  35.69 
 
 		 255 aa  141  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3514  hypothetical protein  36.6 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  35.29 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  35.56 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  35.29 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  34.9 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  34.98 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1788  protein of unknown function DUF81  33.48 
 
 		 279 aa  135  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00173332  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  34.13 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  33.73 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3365  hypothetical protein  35.74 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  35.63 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  35.63 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  32.66 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  32.66 
 
 		 256 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  30.29 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  31.98 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  36.61 
 
 		 258 aa  128  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  31.45 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  32.26 
 
 		 256 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  31.58 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  31.98 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  31.58 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  31.58 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  31.58 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  31.58 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1577  protein of unknown function DUF81  36.02 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  29.71 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  32.48 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  32.8 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  31.85 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  30.59 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1208  protein of unknown function DUF81  36.96 
 
 		 267 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  29.64 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  30.83 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  32.31 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  31.45 
 
 		 261 aa  118  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  31.45 
 
 		 272 aa  118  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  30.67 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  30.08 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  32.17 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  30.52 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  33.47 
 
 		 253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  29.92 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  31.45 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  31.45 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  28.51 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  30.12 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  29.84 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  31.78 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  29.72 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  30.52 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  31.05 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  31.15 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  30.89 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  31.76 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  30.52 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06970  predicted permease  35.19 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497367  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2209  protein of unknown function DUF81  34.91 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000506184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  30.87 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  30.13 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  27.23 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0626  protein of unknown function DUF81  31.33 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  30.43 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  27.76 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1303  membrane protein  33.05 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134864  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  29.88 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  30.08 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>