82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32150 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_32150  anthranilate dioxygenase small subunit  100 
 
 		 163 aa  342  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.447185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2724  anthranilate dioxygenase small subunit  96.93 
 
 		 163 aa  330  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2779  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  47.1 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2635  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  48.39 
 
 		 171 aa  154  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2709  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  45.62 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.135302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2111  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  46.79 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0182348  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2553  benzoate 1,2-dioxygenase  45.81 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08600  benzoate-1,2-dioxygenase oxygenase component, beta subunit  45.81 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2687  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  45.81 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2720  toluate 1,2-dioxygenase subunit beta  43.23 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2369  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  46.5 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714007  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3097  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  44.74 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5351  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  43.23 
 
 		 167 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.449745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3162  benzoate dioxygenase, beta subunit  45.16 
 
 		 161 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.391126  normal  0.421073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32100  toluate 1,2-dioxygenase beta subunit  42.58 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0914  benzoate 1,2-dioxygenase subunit beta BenB  43.23 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2322  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  44.52 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1266  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  38.71 
 
 		 165 aa  141  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4404  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  43.23 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1298  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  44.03 
 
 		 182 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2967  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  43.87 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0472  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  42.58 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0186  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  41.94 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.270999  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0214  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  41.94 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1359  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  41.94 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382783  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2582  benzoate 1,2 dioxygenase, beta subunit  41.94 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1555  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  41.94 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2726  benzoate 1,2 dioxygenase, beta subunit  41.94 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1135  benzoate 1,2-dioxygenase  42.31 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4159  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  40.88 
 
 		 181 aa  134  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1178  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  42.76 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7047  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  43.71 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3863  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  40.65 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1429  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  43.05 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0021557  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1354  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  40.25 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.160412  normal  0.158721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1372  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  39.62 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1406  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  39.62 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1390  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  39.62 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0521663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1000  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  41.94 
 
 		 697 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4883  benzoate 1,2-dioxygenase subunit beta  40 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428911  normal  0.181589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1325  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  46.15 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1365  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  43.71 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0217955  normal  0.119188 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6132  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  45.03 
 
 		 162 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1762  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  43.23 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070154 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6525  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  44.37 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6583  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  43.71 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0528845  normal  0.624635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6298  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  43.71 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502382 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0539  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  38.06 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1592  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  41.72 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.290973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3239  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  43.05 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144552 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1681  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  41.18 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1305  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  45.97 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0827  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  32.62 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0728938  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0889  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.92 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.93204  normal  0.763516 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1875  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  32.72 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2897  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.92 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1757  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.69 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1129  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  31.86 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2824  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  31.86 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2691  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  30.97 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02431  3-phenylpropionate dioxygenase, small (beta) subunit  30.97 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02395  hypothetical protein  30.97 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1138  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  30.97 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2692  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  30.97 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.206867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3555  p-cumate dioxygenase small subunit (CmtAc)  29.46 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0559586  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3771  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  31.86 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1827  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  25.17 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475727  normal  0.661206 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3843  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  27.27 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3245  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  23.13 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000856848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1503  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  30 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.223026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3236  putative dioxygenase beta subunit  28.08 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665811  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3841  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  26.21 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0587  Rieske-type ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  31.82 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104459  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4281  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.3 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119212  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3867  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  21.79 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.996924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2210  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  25 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4347  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  23.03 
 
 		 179 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.285942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1994  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  25.66 
 
 		 180 aa  42  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0166  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  24.8 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000302415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3193  putative aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.85 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4416  benzene 1,2-dioxygenase  28.48 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0637  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  27.56 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>