More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_18041 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_18041  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
352 aa  709    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18071  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.28 
 
 
352 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.85 
 
 
352 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18251  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.28 
 
 
352 aa  544  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.159071  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20671  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.14 
 
 
356 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1192  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.14 
 
 
356 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17401  Holliday junction DNA helicase RuvB  50 
 
 
348 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0162  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.41 
 
 
347 aa  347  2e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2503  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.82 
 
 
370 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.54699  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1365  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.6 
 
 
386 aa  343  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.63 
 
 
366 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01931  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.26 
 
 
398 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2534  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.16 
 
 
360 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.113994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3579  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.16 
 
 
360 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0835  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.16 
 
 
375 aa  334  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0909626  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1892  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.69 
 
 
371 aa  331  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0118  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.13 
 
 
348 aa  330  2e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.28 
 
 
366 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0582053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.31 
 
 
335 aa  319  5e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1205  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.15 
 
 
334 aa  318  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.47 
 
 
338 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.37 
 
 
338 aa  315  5e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.38 
 
 
541 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  45.92 
 
 
341 aa  315  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.05 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1698  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.59 
 
 
334 aa  313  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1731  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.59 
 
 
334 aa  313  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.707795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.05 
 
 
336 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.44 
 
 
333 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.44 
 
 
333 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.81 
 
 
333 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.05 
 
 
336 aa  311  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.05 
 
 
336 aa  311  9e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.44 
 
 
333 aa  311  9e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.82 
 
 
333 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.82 
 
 
333 aa  310  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.74 
 
 
333 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0612  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.74 
 
 
351 aa  310  2e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.44 
 
 
342 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.53 
 
 
347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.83 
 
 
336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.17 
 
 
336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.33 
 
 
333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1452  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.06 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467826  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1678  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.5 
 
 
337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.06 
 
 
344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.31 
 
 
340 aa  305  6e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  47 
 
 
338 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.46 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.65 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.14 
 
 
347 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.52 
 
 
339 aa  304  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.28 
 
 
350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.75 
 
 
344 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.5 
 
 
348 aa  301  9e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.42 
 
 
354 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0578  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.55 
 
 
338 aa  301  1e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.51 
 
 
343 aa  301  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.48 
 
 
336 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  43.52 
 
 
356 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.76 
 
 
330 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.24 
 
 
344 aa  300  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.67 
 
 
338 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.21 
 
 
343 aa  300  3e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.17 
 
 
336 aa  298  6e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.35 
 
 
343 aa  299  6e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3516  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.68 
 
 
346 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.01 
 
 
337 aa  298  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3221  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.68 
 
 
346 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.08 
 
 
345 aa  297  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.67 
 
 
337 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.89 
 
 
347 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.65 
 
 
349 aa  296  4e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.48 
 
 
353 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  48 
 
 
336 aa  295  7e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0471  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.5 
 
 
343 aa  295  7e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  42.36 
 
 
354 aa  295  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.67 
 
 
352 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.48 
 
 
351 aa  294  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.06 
 
 
336 aa  294  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.89 
 
 
351 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  45.95 
 
 
349 aa  294  2e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.52 
 
 
352 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.35 
 
 
338 aa  293  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.33 
 
 
353 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  46 
 
 
352 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.81 
 
 
339 aa  293  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0928  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.05 
 
 
354 aa  293  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.35 
 
 
349 aa  293  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1357  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.27 
 
 
351 aa  293  4e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.24 
 
 
346 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.95 
 
 
338 aa  293  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4544  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.28 
 
 
360 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.076063  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.57 
 
 
337 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  43.12 
 
 
343 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.79 
 
 
334 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.79 
 
 
334 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.45 
 
 
347 aa  292  5e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  47 
 
 
336 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  47 
 
 
336 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>