More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_10011 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_10011  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  100 
 
 
165 aa  342  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0882  tRNA-adenosine deaminase  70.39 
 
 
171 aa  242  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09411  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  65.45 
 
 
171 aa  239  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09421  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  73.79 
 
 
145 aa  233  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.362646  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10241  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  57.05 
 
 
165 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.237232 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0143  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  60.84 
 
 
155 aa  190  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07751  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  59.44 
 
 
155 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal  0.0539012 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16461  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  54.79 
 
 
163 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1262  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  54.48 
 
 
147 aa  181  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1208  tRNA-adenosine deaminase  53.52 
 
 
174 aa  175  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.755847 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.18 
 
 
162 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4089  tRNA-adenosine deaminase  37.24 
 
 
156 aa  130  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.24 
 
 
154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.24 
 
 
154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.26 
 
 
174 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  40.15 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.76 
 
 
165 aa  125  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  41.5 
 
 
161 aa  123  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  38.89 
 
 
144 aa  120  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  36.84 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1856  tRNA-adenosine deaminase  36.97 
 
 
168 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.489212  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  36.24 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.88 
 
 
154 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.78 
 
 
148 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  42.64 
 
 
150 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.9 
 
 
223 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  33.78 
 
 
158 aa  115  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  34.9 
 
 
149 aa  114  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  40.46 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.84 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.23 
 
 
168 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.66 
 
 
158 aa  111  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.57 
 
 
161 aa  110  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.11 
 
 
148 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.1 
 
 
160 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  35.25 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.98 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.06 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0088  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.94 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  33.99 
 
 
172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  33.99 
 
 
172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.09 
 
 
176 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.42 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  33.99 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  33.99 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0208  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.34 
 
 
190 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.672477  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  33.99 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  39.69 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0357  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.88 
 
 
154 aa  108  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  33.33 
 
 
153 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.62 
 
 
166 aa  108  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.69 
 
 
151 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.9 
 
 
170 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.32 
 
 
154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.69 
 
 
179 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  33.33 
 
 
165 aa  107  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.69 
 
 
189 aa  107  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  32.89 
 
 
153 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.89 
 
 
169 aa  107  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  36.24 
 
 
200 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  36.24 
 
 
187 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  33.78 
 
 
168 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  40.32 
 
 
160 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  34.23 
 
 
222 aa  107  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  38.17 
 
 
176 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.21 
 
 
157 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  35.06 
 
 
167 aa  107  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.72 
 
 
475 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  34.21 
 
 
165 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.99 
 
 
165 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  36.05 
 
 
168 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  36.24 
 
 
200 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.21 
 
 
165 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.97 
 
 
164 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.64 
 
 
156 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.09 
 
 
154 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  35.81 
 
 
183 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.56 
 
 
164 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.41 
 
 
152 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.94 
 
 
176 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0327  putative deaminase  39.69 
 
 
159 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.76 
 
 
175 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.14 
 
 
166 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.65 
 
 
175 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.25 
 
 
162 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.43 
 
 
175 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  35.88 
 
 
222 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1214  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.53 
 
 
149 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  33.13 
 
 
172 aa  105  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.07 
 
 
190 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.11 
 
 
252 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  33.12 
 
 
169 aa  104  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  36.73 
 
 
171 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.25 
 
 
166 aa  104  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0650  tRNA-adenosine deaminase  38.28 
 
 
159 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  35.42 
 
 
151 aa  104  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.12 
 
 
194 aa  104  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6533  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.91 
 
 
185 aa  104  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.91 
 
 
151 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>