23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_02581 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_02581  Beta-carotene hydroxylase  100 
 
 
241 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.489908  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  98.34 
 
 
277 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  95.42 
 
 
266 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  87.97 
 
 
299 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  78.15 
 
 
341 aa  407  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  70.54 
 
 
349 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  71.43 
 
 
346 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  69.29 
 
 
370 aa  376  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  75.1 
 
 
343 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  74.27 
 
 
343 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  64.06 
 
 
331 aa  319  3e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  63.72 
 
 
306 aa  299  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  60.85 
 
 
298 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  61.65 
 
 
291 aa  288  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  61.65 
 
 
291 aa  288  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  62.14 
 
 
291 aa  285  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  59.43 
 
 
325 aa  278  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  61.65 
 
 
293 aa  274  9e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  31.61 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  31.71 
 
 
685 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  29.07 
 
 
309 aa  62.8  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  23.58 
 
 
342 aa  45.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  22.37 
 
 
368 aa  42.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>