More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_15571 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  65.98 
 
 
518 aa  634    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 
470 aa  636    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
462 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.01 
 
 
470 aa  641    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  66.11 
 
 
471 aa  640    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 
464 aa  639    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  69.83 
 
 
487 aa  673    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  80.92 
 
 
482 aa  790    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4484  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.33 
 
 
482 aa  644    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.86 
 
 
469 aa  639    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.86 
 
 
469 aa  639    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.86 
 
 
469 aa  639    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.45 
 
 
470 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5018  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.26 
 
 
485 aa  774    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.12 
 
 
484 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.73 
 
 
462 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0970  F0F1 ATP synthase subunit beta  94.05 
 
 
488 aa  909    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.7 
 
 
483 aa  794    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.13 
 
 
464 aa  636    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.64 
 
 
469 aa  637    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.5 
 
 
476 aa  640    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.34 
 
 
482 aa  796    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
475 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
465 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 
462 aa  637    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
475 aa  643    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.14 
 
 
468 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.14 
 
 
468 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
482 aa  644    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0504  F0F1 ATP synthase subunit beta  90.55 
 
 
487 aa  886    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0754046  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
462 aa  643    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2171  F0F1 ATP synthase subunit beta  90.55 
 
 
487 aa  884    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.22 
 
 
470 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  68.63 
 
 
465 aa  638    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.34 
 
 
476 aa  646    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.86 
 
 
469 aa  639    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.8 
 
 
509 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1531  F0F1 ATP synthase subunit beta  93.62 
 
 
486 aa  905    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2315  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.5 
 
 
484 aa  821    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.924902  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05021  F0F1 ATP synthase subunit beta  92.01 
 
 
532 aa  885    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.64 
 
 
470 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.43 
 
 
462 aa  653    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.7 
 
 
483 aa  794    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.48 
 
 
482 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18381  F0F1 ATP synthase subunit beta  94.25 
 
 
488 aa  909    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.61509  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.92 
 
 
476 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.29 
 
 
481 aa  635    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.01 
 
 
471 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5090  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.84 
 
 
482 aa  783    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.71 
 
 
476 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 
480 aa  634    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 
471 aa  639    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
475 aa  643    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15571  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
488 aa  985    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.92 
 
 
476 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.13 
 
 
476 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.21 
 
 
462 aa  662    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16171  F0F1 ATP synthase subunit beta  93 
 
 
486 aa  897    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.51 
 
 
474 aa  637    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  67.58 
 
 
468 aa  641    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.55 
 
 
474 aa  635    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.04 
 
 
473 aa  649    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.78 
 
 
519 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4503  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.33 
 
 
482 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.14 
 
 
465 aa  634    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.04 
 
 
473 aa  648    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.4 
 
 
484 aa  766    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  68.71 
 
 
467 aa  646    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16401  F0F1 ATP synthase subunit beta  93.42 
 
 
486 aa  903    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16281  F0F1 ATP synthase subunit beta  93.42 
 
 
486 aa  904    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.210886  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 
474 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.64 
 
 
470 aa  641    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.15 
 
 
462 aa  648    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.29 
 
 
469 aa  636    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 
471 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.01 
 
 
471 aa  638    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.86 
 
 
481 aa  651    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 
474 aa  637    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  67.16 
 
 
503 aa  631  1e-180  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.08 
 
 
468 aa  631  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.36 
 
 
478 aa  632  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  66.88 
 
 
547 aa  633  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.52 
 
 
467 aa  633  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  65.55 
 
 
530 aa  633  1e-180  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.08 
 
 
468 aa  631  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.23 
 
 
474 aa  634  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.74 
 
 
513 aa  634  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0420  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.39 
 
 
469 aa  632  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.29 
 
 
468 aa  632  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 
465 aa  632  1e-180  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.78 
 
 
521 aa  628  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.97 
 
 
475 aa  628  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.78 
 
 
521 aa  628  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.94 
 
 
474 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  65.85 
 
 
501 aa  630  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.08 
 
 
468 aa  631  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.18 
 
 
484 aa  628  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3966  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.95 
 
 
470 aa  625  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000531769  normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0308  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.39 
 
 
468 aa  626  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0848804 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.44 
 
 
517 aa  625  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>