50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_14511 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_14511  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385479 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  42.7 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  41.57 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  45.71 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04591  hypothetical protein  56.9 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  38.64 
 
 
188 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05141  hypothetical protein  43.84 
 
 
163 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.62 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  36.99 
 
 
166 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1738  XRE family transcriptional regulator  36.05 
 
 
273 aa  50.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  31.88 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  38.46 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  27.37 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  27.37 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1871  hypothetical protein  36.76 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  34.78 
 
 
284 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 
351 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0349  hypothetical protein  27.27 
 
 
398 aa  47  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00827642  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  32.39 
 
 
374 aa  46.6  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  31.65 
 
 
260 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  27.15 
 
 
256 aa  47  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 
199 aa  46.6  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  28.45 
 
 
293 aa  46.6  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  36.23 
 
 
248 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  36.23 
 
 
248 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  31.71 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04831  hypothetical protein  38.36 
 
 
164 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2609  hypothetical protein  27.4 
 
 
350 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  32.53 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 
312 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  31.71 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  25.29 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  32.84 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  31.71 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  30.49 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  27.78 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  27.69 
 
 
360 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  30.49 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  30.49 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  30.99 
 
 
510 aa  43.5  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  30.49 
 
 
303 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  30.49 
 
 
303 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  30.49 
 
 
303 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  30.49 
 
 
303 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  27.69 
 
 
360 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  28.05 
 
 
308 aa  43.1  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  27.03 
 
 
367 aa  42.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  20.14 
 
 
272 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>