More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_02751 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  59.79 
 
 
206 aa  254  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  56.84 
 
 
206 aa  229  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  52.71 
 
 
205 aa  228  6e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  53.33 
 
 
202 aa  224  9e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  52.82 
 
 
202 aa  221  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02831  peptidyl-tRNA hydrolase  45.31 
 
 
199 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.396706  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  46.63 
 
 
208 aa  184  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  50.78 
 
 
213 aa  184  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  48.47 
 
 
209 aa  182  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  49.48 
 
 
219 aa  182  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.69 
 
 
213 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02731  peptidyl-tRNA hydrolase  45.55 
 
 
198 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02721  peptidyl-tRNA hydrolase  45.79 
 
 
200 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.778009  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  45.26 
 
 
200 aa  175  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.56 
 
 
202 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  46.84 
 
 
187 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  44.56 
 
 
202 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  46.63 
 
 
210 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  42.19 
 
 
188 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 
185 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.2 
 
 
206 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 
191 aa  153  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
217 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  45.51 
 
 
186 aa  151  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
214 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  41.95 
 
 
189 aa  149  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 
195 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  43.92 
 
 
196 aa  148  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 
190 aa  148  6e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  38.14 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  40.53 
 
 
189 aa  145  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0182  peptidyl-tRNA hydrolase  41.36 
 
 
190 aa  145  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 
183 aa  144  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  42.49 
 
 
180 aa  144  8.000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.97 
 
 
206 aa  144  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 
193 aa  144  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  42.71 
 
 
190 aa  143  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 
189 aa  142  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  36.32 
 
 
188 aa  142  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.4 
 
 
186 aa  141  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.29 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  38.14 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  42.42 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  42.42 
 
 
210 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  43.67 
 
 
186 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.67 
 
 
186 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.67 
 
 
186 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  43.08 
 
 
190 aa  139  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  42.42 
 
 
207 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  41.33 
 
 
217 aa  139  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  43.67 
 
 
186 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  42.42 
 
 
207 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  42.42 
 
 
207 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02582  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 
193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00538326  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
188 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  39.49 
 
 
186 aa  137  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 
184 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  38.95 
 
 
192 aa  136  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  38.12 
 
 
185 aa  137  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  37.37 
 
 
194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.53 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 
187 aa  135  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  41.57 
 
 
188 aa  135  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  40.41 
 
 
193 aa  135  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  37.93 
 
 
194 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  41.57 
 
 
188 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  39.49 
 
 
186 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2570  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 
194 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
190 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000106612  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2205  peptidyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  37.76 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  37.17 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  40.68 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 
189 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 
205 aa  131  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  45.19 
 
 
201 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  45.19 
 
 
201 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  37.69 
 
 
201 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3160  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 
186 aa  131  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  40.41 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  37 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  37.64 
 
 
196 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1128  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 
225 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  38.2 
 
 
198 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  34.72 
 
 
189 aa  129  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.11 
 
 
193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  36.08 
 
 
192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0584  peptidyl-tRNA hydrolase  43.04 
 
 
186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.691256  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>