86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3725 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3725  phosphoserine phosphatase  100 
 
 
191 aa  392  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2079  phosphoserine phosphatase  64.52 
 
 
205 aa  251  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22014  hitchhiker  0.00429675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1758  phosphoserine phosphatase  65.22 
 
 
205 aa  250  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733968  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3550  phosphoserine phosphatase  64.67 
 
 
205 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2544  phosphoserine phosphatase  63.59 
 
 
205 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.938573  hitchhiker  0.0000142825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41830  phosphoserine phosphatase  63.59 
 
 
205 aa  245  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2281  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  62.37 
 
 
237 aa  243  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2053  phosphoserine phosphatase  63.3 
 
 
204 aa  240  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1581  phosphoserine phosphatase  63.04 
 
 
204 aa  238  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.051516  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1670  phosphoserine phosphatase  58.06 
 
 
205 aa  229  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.685249  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0057  phosphoserine phosphatase  57.29 
 
 
203 aa  229  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0583  phosphoserine phosphatase  58.95 
 
 
202 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0818  phosphoserine phosphatase  57.37 
 
 
201 aa  228  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3211  phosphoserine phosphatase  56.61 
 
 
204 aa  222  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3902  phosphoserine phosphatase  57.14 
 
 
205 aa  220  9e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1629  phosphoserine phosphatase  57.07 
 
 
204 aa  218  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1390  phosphoserine phosphatase  52.91 
 
 
202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1446  phosphoserine phosphatase  52.08 
 
 
200 aa  209  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343477  normal  0.353206 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24420  phosphoserine phosphatase  50.26 
 
 
203 aa  206  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0290  phosphoserine phosphatase  52.6 
 
 
201 aa  202  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1112  phosphoserine phosphatase  33.16 
 
 
223 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1255  hypothetical protein  42.86 
 
 
177 aa  85.9  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  28.24 
 
 
400 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  27.33 
 
 
298 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  27.65 
 
 
400 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0330  phosphoserine phosphatase SerB  25.43 
 
 
207 aa  51.6  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.414874  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0308  phosphoserine phosphatase SerB  24.86 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  25 
 
 
291 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1689  phosphoserine phosphatase SerB  25 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  26.14 
 
 
400 aa  49.3  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  27.17 
 
 
429 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  26.44 
 
 
410 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  26.44 
 
 
418 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  27.68 
 
 
410 aa  48.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1582  phosphoserine phosphatase SerB  23.7 
 
 
208 aa  48.1  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  26.21 
 
 
435 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  26.28 
 
 
295 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  28.67 
 
 
413 aa  47  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  26.32 
 
 
298 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  28.86 
 
 
405 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  26.67 
 
 
411 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  30.52 
 
 
404 aa  46.2  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  26.14 
 
 
223 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  25.29 
 
 
418 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1689  phosphoserine phosphatase SerB  27.74 
 
 
216 aa  46.2  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1659  phosphoserine phosphatase SerB  22.54 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00929582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  25.71 
 
 
404 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  30.63 
 
 
411 aa  45.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  26.28 
 
 
398 aa  45.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  31.94 
 
 
281 aa  45.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  28.3 
 
 
296 aa  44.7  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  27.01 
 
 
404 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1813  copper-translocating P-type ATPase  28 
 
 
800 aa  44.7  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  26.71 
 
 
406 aa  44.7  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0208  phosphoserine phosphatase SerB  24.12 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00413015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  25.14 
 
 
404 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  26.44 
 
 
429 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  26.59 
 
 
438 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  25.14 
 
 
415 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  29.38 
 
 
419 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  26.9 
 
 
325 aa  43.5  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  30 
 
 
404 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  27.01 
 
 
410 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  25.14 
 
 
404 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  26.42 
 
 
291 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  26.18 
 
 
409 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2695  phosphoserine phosphatase SerB  25.16 
 
 
206 aa  42.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.687982  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  48.84 
 
 
793 aa  42.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  27.57 
 
 
398 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  25 
 
 
297 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  26.28 
 
 
299 aa  42  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  27.11 
 
 
412 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  26.32 
 
 
325 aa  42  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  29.1 
 
 
814 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  25.48 
 
 
291 aa  41.6  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  24.71 
 
 
213 aa  41.6  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  29.25 
 
 
408 aa  41.6  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  26.84 
 
 
406 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  27.12 
 
 
316 aa  41.2  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1182  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  37.31 
 
 
782 aa  41.2  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.49521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  25.27 
 
 
303 aa  41.2  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1052  phosphoserine phosphatase SerB  23.94 
 
 
210 aa  41.2  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  27.52 
 
 
404 aa  41.2  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03190  membrane protein, putative  30.08 
 
 
1592 aa  41.2  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  22.3 
 
 
297 aa  41.2  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  28.97 
 
 
404 aa  41.2  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>