42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3902 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3902  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3211  phosphoserine phosphatase  89.71 
 
 		 204 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2053  phosphoserine phosphatase  65.64 
 
 		 204 aa  258  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0057  phosphoserine phosphatase  56.92 
 
 		 203 aa  241  7e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1581  phosphoserine phosphatase  61.08 
 
 		 204 aa  236  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.051516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0818  phosphoserine phosphatase  55.78 
 
 		 201 aa  234  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1629  phosphoserine phosphatase  59 
 
 		 204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1758  phosphoserine phosphatase  58.2 
 
 		 205 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0583  phosphoserine phosphatase  57.95 
 
 		 202 aa  231  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2079  phosphoserine phosphatase  58.73 
 
 		 205 aa  229  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22014  hitchhiker  0.00429675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41830  phosphoserine phosphatase  57.67 
 
 		 205 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3550  phosphoserine phosphatase  56.61 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2281  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  55.5 
 
 		 237 aa  228  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0290  phosphoserine phosphatase  60.64 
 
 		 201 aa  228  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2544  phosphoserine phosphatase  55 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.938573  hitchhiker  0.0000142825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3725  phosphoserine phosphatase  57.14 
 
 		 191 aa  220  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1390  phosphoserine phosphatase  57.89 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1670  phosphoserine phosphatase  54.59 
 
 		 205 aa  215  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.685249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1446  phosphoserine phosphatase  54.36 
 
 		 200 aa  213  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343477  normal  0.353206 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24420  phosphoserine phosphatase  51.28 
 
 		 203 aa  211  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1112  phosphoserine phosphatase  32.65 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1255  hypothetical protein  49.17 
 
 		 177 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  33.86 
 
 		 782 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  24.64 
 
 		 413 aa  46.2  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  33.07 
 
 		 782 aa  45.1  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  28.02 
 
 		 404 aa  45.1  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  27.43 
 
 		 418 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0721  cadmium-translocating P-type ATPase  32.52 
 
 		 646 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000381193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2319  phosphoserine phosphatase SerB  30.71 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  29.55 
 
 		 418 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  28.19 
 
 		 400 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3373  phosphoserine phosphatase  27.34 
 
 		 330 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  25.68 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  27.68 
 
 		 410 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  25.75 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  29.09 
 
 		 298 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  28.4 
 
 		 292 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  22.54 
 
 		 400 aa  42.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1582  phosphoserine phosphatase SerB  22.22 
 
 		 208 aa  42  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  31.87 
 
 		 835 aa  42  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  26.95 
 
 		 223 aa  41.6  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1689  phosphoserine phosphatase SerB  29.7 
 
 		 216 aa  41.2  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>