81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0057 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0057  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 203 aa  421  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0583  phosphoserine phosphatase  82.59 
 
 		 202 aa  349  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0818  phosphoserine phosphatase  77.78 
 
 		 201 aa  333  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2053  phosphoserine phosphatase  68.69 
 
 		 204 aa  289  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1629  phosphoserine phosphatase  65.67 
 
 		 204 aa  281  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1581  phosphoserine phosphatase  62 
 
 		 204 aa  264  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.051516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3550  phosphoserine phosphatase  62.87 
 
 		 205 aa  264  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41830  phosphoserine phosphatase  62.87 
 
 		 205 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1390  phosphoserine phosphatase  59.9 
 
 		 202 aa  260  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2544  phosphoserine phosphatase  62.63 
 
 		 205 aa  256  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.938573  hitchhiker  0.0000142825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2281  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  62.12 
 
 		 237 aa  254  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1758  phosphoserine phosphatase  61.62 
 
 		 205 aa  254  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2079  phosphoserine phosphatase  61.62 
 
 		 205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22014  hitchhiker  0.00429675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3211  phosphoserine phosphatase  56.92 
 
 		 204 aa  241  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1670  phosphoserine phosphatase  57.07 
 
 		 205 aa  241  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.685249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3902  phosphoserine phosphatase  56.92 
 
 		 205 aa  241  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24420  phosphoserine phosphatase  55.5 
 
 		 203 aa  239  2e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3725  phosphoserine phosphatase  57.29 
 
 		 191 aa  229  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0290  phosphoserine phosphatase  55.72 
 
 		 201 aa  226  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1446  phosphoserine phosphatase  51 
 
 		 200 aa  223  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343477  normal  0.353206 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1255  hypothetical protein  48.41 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1112  phosphoserine phosphatase  32.67 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  28.22 
 
 		 405 aa  58.5  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  26.34 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  28.65 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  25.54 
 
 		 400 aa  54.7  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  28.23 
 
 		 404 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  24.46 
 
 		 435 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  28.08 
 
 		 429 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  27.64 
 
 		 405 aa  51.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  24.63 
 
 		 412 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  24.37 
 
 		 398 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  26.47 
 
 		 418 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  29.61 
 
 		 298 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  26.83 
 
 		 404 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  25.73 
 
 		 429 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  26.63 
 
 		 398 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  27.18 
 
 		 405 aa  49.7  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  26.57 
 
 		 429 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  26.32 
 
 		 410 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  28.78 
 
 		 407 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  26.73 
 
 		 418 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  24.34 
 
 		 413 aa  49.3  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  25.63 
 
 		 404 aa  48.9  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  28.29 
 
 		 406 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1074  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  25.64 
 
 		 634 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.195492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  29.21 
 
 		 419 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0330  phosphoserine phosphatase SerB  30.08 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.414874  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  23.94 
 
 		 400 aa  47.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  25.74 
 
 		 415 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  25.74 
 
 		 404 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  25.12 
 
 		 404 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1689  phosphoserine phosphatase SerB  26 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  29.73 
 
 		 419 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  25.74 
 
 		 404 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  26.63 
 
 		 405 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2319  phosphoserine phosphatase SerB  31.29 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  25 
 
 		 327 aa  45.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  25 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  25.85 
 
 		 438 aa  45.8  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  26.47 
 
 		 408 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  23.9 
 
 		 332 aa  45.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  27.8 
 
 		 411 aa  45.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  26.78 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0308  phosphoserine phosphatase SerB  28.28 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  27.37 
 
 		 291 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  25.13 
 
 		 404 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  22.66 
 
 		 410 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  26.79 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  25.25 
 
 		 404 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  26.83 
 
 		 325 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  27.72 
 
 		 406 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  23.84 
 
 		 292 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  27.57 
 
 		 421 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  25.6 
 
 		 325 aa  42.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0375  hydrolase  30.83 
 
 		 265 aa  42  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  23.92 
 
 		 291 aa  41.6  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1170  SerB family protein  26.29 
 
 		 290 aa  41.6  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  24.88 
 
 		 325 aa  41.2  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  26.85 
 
 		 857 aa  41.2  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  28.77 
 
 		 409 aa  41.2  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>