More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3555 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3555  ribosomal RNA adenine methylase transferase  100 
 
 		 277 aa  556  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.819299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  40.37 
 
 		 299 aa  158  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  38.95 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 		 293 aa  148  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  38.11 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  34.42 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  37.7 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  32.62 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  39.27 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  32.51 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  37.05 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  34.05 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  33.21 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  34.19 
 
 		 302 aa  138  8.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  35.94 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  36.09 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  36.09 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  32.97 
 
 		 292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 297 aa  135  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 297 aa  135  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  40.59 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  35.25 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  41.77 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  37.84 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  33.1 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  38.03 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  36.65 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  32.79 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  37.41 
 
 		 281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  32.77 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  36.9 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1084  dimethyladenosine transferase  37.92 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  34.21 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  33.07 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  34.31 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  38.04 
 
 		 288 aa  128  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  32.85 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  31.91 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3509  dimethyladenosine transferase  32.41 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.627575  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07480  dimethyladenosine transferase  35.97 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.962879 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  31.62 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  38.84 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  31.72 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  34.62 
 
 		 286 aa  125  5e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  36 
 
 		 305 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07111  dimethyladenosine transferase  35.27 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.139914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  37.87 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  38.72 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  35.25 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  30.74 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  37.96 
 
 		 289 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30300  dimethyladenosine transferase  37.04 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.222246 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  34.77 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  33.59 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  34.8 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13300  dimethyladenosine transferase  39.18 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0481014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2059  dimethyladenosine transferase  34.92 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.740461  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1045  dimethyladenosine transferase  42.54 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46051  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  33.62 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0501  dimethyladenosine transferase  37.11 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000511271 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  36.48 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1363  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 		 266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  33.19 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  33.21 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  35.29 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  33.96 
 
 		 276 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  34.63 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  36.33 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0975  dimethyladenosine transferase  41.1 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139064  hitchhiker  0.00622345 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  34.13 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6704  predicted protein  35.86 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.477896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  32.16 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  33.71 
 
 		 275 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  34.51 
 
 		 268 aa  118  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  33.95 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32460  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.956525 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  37.87 
 
 		 293 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1283  dimethyladenosine transferase  33.58 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  37.08 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  36.76 
 
 		 305 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  36.14 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  34.19 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  35.45 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>