More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2088 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2088  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 343 aa  694    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225095 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  37.69 
 
 		 340 aa  229  7e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  37.35 
 
 		 442 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  37.73 
 
 		 422 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  38.62 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  35.42 
 
 		 398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  36.96 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  37.35 
 
 		 424 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  40.19 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  38.58 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  38.58 
 
 		 428 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  38.99 
 
 		 443 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  36.56 
 
 		 438 aa  219  7e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  36.09 
 
 		 436 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  38.17 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  35.05 
 
 		 443 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  37.69 
 
 		 432 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  37.8 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.83 
 
 		 419 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  37.5 
 
 		 420 aa  216  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  36.86 
 
 		 421 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  37.94 
 
 		 429 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  37.58 
 
 		 432 aa  215  7e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  37.27 
 
 		 432 aa  215  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  37.98 
 
 		 432 aa  215  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  37.61 
 
 		 430 aa  215  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  39.1 
 
 		 446 aa  215  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  37.98 
 
 		 432 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  37.98 
 
 		 432 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  37.39 
 
 		 432 aa  215  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  37.98 
 
 		 434 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2797  glutamyl-tRNA reductase  38.35 
 
 		 435 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  37.98 
 
 		 434 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  37.98 
 
 		 434 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  37.98 
 
 		 434 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  37.39 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  37.39 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  37.98 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  36.42 
 
 		 416 aa  212  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  34.67 
 
 		 420 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  37.3 
 
 		 421 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3145  glutamyl-tRNA reductase  38.05 
 
 		 435 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0225946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  36.47 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.14 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  35.63 
 
 		 416 aa  210  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 		 440 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2900  glutamyl-tRNA reductase  38.35 
 
 		 435 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 		 414 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  36.2 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  36.2 
 
 		 432 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  37.18 
 
 		 426 aa  208  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  32.44 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.3 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  37.82 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  37.82 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  36.69 
 
 		 420 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  34.12 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  36.69 
 
 		 420 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  38.22 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  34.12 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  38.22 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  36.8 
 
 		 440 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  34.53 
 
 		 434 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  37.82 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0776  glutamyl-tRNA reductase  36.5 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.163428 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  37.31 
 
 		 432 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  37.5 
 
 		 428 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3663  glutamyl-tRNA reductase  37.08 
 
 		 432 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.216962  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  37.18 
 
 		 425 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  35.8 
 
 		 436 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  36.86 
 
 		 425 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  37.82 
 
 		 425 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  34.69 
 
 		 434 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  37.54 
 
 		 436 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  36.53 
 
 		 446 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0118  glutamyl-tRNA reductase  36.09 
 
 		 413 aa  203  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000526977  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2065  glutamyl-tRNA reductase  36.09 
 
 		 431 aa  203  3e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  36.31 
 
 		 418 aa  203  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  33.92 
 
 		 443 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.8 
 
 		 423 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  34.26 
 
 		 434 aa  203  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 434 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  33.91 
 
 		 418 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  34.04 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0919  glutamyl-tRNA reductase  36.12 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  38.59 
 
 		 439 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  33.93 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  36.31 
 
 		 449 aa  200  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  34.56 
 
 		 420 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0781  glutamyl-tRNA reductase  35.15 
 
 		 436 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  38.49 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  33.13 
 
 		 454 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  34.77 
 
 		 464 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  37.46 
 
 		 446 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  37.15 
 
 		 446 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  37.15 
 
 		 446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  34.39 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2180  glutamyl-tRNA reductase  36.69 
 
 		 438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00403267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  32.84 
 
 		 443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>