More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0748 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0748  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.43 
 
 
149 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891239  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1598  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.74 
 
 
207 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  42.5 
 
 
163 aa  94  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  39.66 
 
 
176 aa  92  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  40.35 
 
 
176 aa  91.7  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  32.59 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  43.59 
 
 
163 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  34.9 
 
 
167 aa  89  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  38.52 
 
 
165 aa  89.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.61 
 
 
234 aa  88.2  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.4 
 
 
170 aa  88.2  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  34.04 
 
 
182 aa  87.8  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  33.33 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  32.12 
 
 
215 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
182 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1210  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.72 
 
 
160 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00161694  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.5 
 
 
165 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  34.57 
 
 
162 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  36.48 
 
 
163 aa  87  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  32.59 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  32.59 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  32.59 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  38.52 
 
 
165 aa  86.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  34.57 
 
 
162 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  35.29 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  32.59 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1664  NADH dehydrogenase subunit I  31.07 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.910659  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0146  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.34 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00110619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  32.59 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  33.55 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  35.19 
 
 
165 aa  85.9  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.33 
 
 
449 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  33.82 
 
 
182 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  36.13 
 
 
162 aa  85.5  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  33.95 
 
 
162 aa  85.1  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 
162 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2631  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.17 
 
 
230 aa  84.7  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.87866  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 
162 aa  85.1  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 
162 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 
162 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  35.54 
 
 
176 aa  84.3  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 
162 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 
162 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
163 aa  84.3  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 
162 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 
162 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  40.83 
 
 
163 aa  84.3  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 
162 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 
162 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 
162 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2993  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.85 
 
 
440 aa  84.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  31.01 
 
 
215 aa  84.3  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  35.53 
 
 
164 aa  84.3  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  38.98 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  31.01 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.68 
 
 
135 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1820  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
211 aa  84  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000189199  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  38.98 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  38.98 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  38.98 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0591  NADH dehydrogenase subunit I  34.07 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0623179  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  33.95 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  30.3 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  34.44 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  34.21 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  30.3 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  30.3 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0257  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  33.33 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  31.3 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  31.3 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  37.14 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  35.11 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  38.33 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  30.3 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  31.3 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  36.72 
 
 
273 aa  82  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0580  NADH dehydrogenase subunit I  34.07 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0627884  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  41.35 
 
 
171 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  40.57 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  32.06 
 
 
180 aa  82  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  31.01 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  35.59 
 
 
160 aa  82  0.000000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0759  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.45 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207287  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  33.1 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  31.01 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  37.19 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  33.1 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  39.17 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>