More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0744 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
191 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1594  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  70.39 
 
 
187 aa  229  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0200  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  71.53 
 
 
176 aa  226  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  64.56 
 
 
166 aa  207  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  65.75 
 
 
179 aa  204  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.41 
 
 
179 aa  204  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  61.33 
 
 
213 aa  202  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  62.35 
 
 
179 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  62.35 
 
 
179 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  62.35 
 
 
179 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  62.35 
 
 
172 aa  201  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  62.35 
 
 
172 aa  201  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  62.35 
 
 
172 aa  201  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  62.35 
 
 
172 aa  201  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  62.35 
 
 
172 aa  201  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  62.66 
 
 
172 aa  201  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  59.59 
 
 
794 aa  200  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  63.06 
 
 
172 aa  200  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  65.96 
 
 
184 aa  200  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  63.69 
 
 
170 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  61.73 
 
 
172 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2045  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.29 
 
 
196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0111546  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  63.45 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  63.38 
 
 
173 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  63.89 
 
 
178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  58.82 
 
 
791 aa  198  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  63.69 
 
 
170 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  62.41 
 
 
793 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  58.22 
 
 
794 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.54 
 
 
183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  64.54 
 
 
183 aa  195  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  65.93 
 
 
268 aa  195  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.43 
 
 
180 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  65.93 
 
 
268 aa  194  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 
183 aa  194  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  62.5 
 
 
167 aa  194  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  60.78 
 
 
167 aa  193  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  60.27 
 
 
792 aa  193  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1126  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
212 aa  192  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  60.96 
 
 
167 aa  192  2e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  59.46 
 
 
159 aa  192  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 
174 aa  192  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  57.23 
 
 
216 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.41 
 
 
202 aa  192  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  53.3 
 
 
222 aa  191  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  56.25 
 
 
264 aa  191  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.7 
 
 
183 aa  191  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  58.78 
 
 
159 aa  191  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0546  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
161 aa  191  5e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
159 aa  191  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  62.41 
 
 
271 aa  191  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
159 aa  191  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.55 
 
 
225 aa  191  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1617  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
161 aa  191  5e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.69 
 
 
170 aa  191  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  54.6 
 
 
220 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.6 
 
 
220 aa  191  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  54.6 
 
 
220 aa  191  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  54.6 
 
 
220 aa  191  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  54.6 
 
 
220 aa  191  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  54.6 
 
 
220 aa  191  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  54.6 
 
 
220 aa  191  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  54.6 
 
 
220 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  54.6 
 
 
220 aa  191  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 
158 aa  191  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.7 
 
 
184 aa  191  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
167 aa  190  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  61.7 
 
 
264 aa  190  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 
170 aa  190  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  59.31 
 
 
185 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  58.5 
 
 
159 aa  190  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
158 aa  190  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  60.71 
 
 
158 aa  189  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  64.93 
 
 
184 aa  190  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.5 
 
 
159 aa  189  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  54.6 
 
 
220 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  60.54 
 
 
160 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.7 
 
 
226 aa  189  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.76 
 
 
170 aa  189  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  54.6 
 
 
220 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  54.6 
 
 
220 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  54.6 
 
 
220 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1206  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.39 
 
 
175 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000567314  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  63.5 
 
 
158 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  54.6 
 
 
220 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1119  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.12 
 
 
231 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.722994  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0928  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 
160 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0103047  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  62.77 
 
 
159 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  63.5 
 
 
160 aa  188  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0950  NADH dehydrogenase subunit B  62.04 
 
 
158 aa  188  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0972476  normal  0.726219 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  62.77 
 
 
159 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  62.77 
 
 
159 aa  188  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  63.5 
 
 
160 aa  188  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  62.77 
 
 
159 aa  188  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  62.77 
 
 
159 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  62.77 
 
 
159 aa  188  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  57.96 
 
 
222 aa  187  5e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  62.77 
 
 
173 aa  188  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  62.77 
 
 
159 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  62.77 
 
 
159 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>