More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0398 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0398  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  507  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.36918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.58 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  35.46 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.36 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.36 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  34.35 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.59 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0244  hypothetical protein  31 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.450187  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4423  flagellar basal body rod protein FlgG  30.83 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.6 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  33.46 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1683  flagellar basal body rod protein FlgG  30.97 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.082538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.62 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.58 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  30.31 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  32 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  32.2 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2845  flagellar basal body rod protein FlgG  31.13 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  0.0904006 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0803  flagellar basal body rod protein FlgG  31.66 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  29.84 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  32.56 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  30.45 
 
 		 262 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1470  flagellar basal body rod protein FlgG  31.13 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185183  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2347  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.63 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  31.13 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4385  flagellar basal body rod protein FlgG  30.74 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368986  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  31.13 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2184  flagellar basal body rod protein FlgG  33.85 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.012527  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.92 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  34.1 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  30.42 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  32 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  31.42 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  31.2 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  31.2 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  30.42 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  32 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0154  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.53 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.469359  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.23 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  29.23 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  31.37 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.23 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  30.35 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1742  flagellar basal body rod protein  33.33 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2264  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.68 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  31.03 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  31.09 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  31.09 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  31.09 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  31.09 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  31.4 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  31.09 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  31.09 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  31.09 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  33.47 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.19 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3787  flagellar basal body rod protein FlgG  29.06 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0961005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  30.04 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3101  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.68 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  30.77 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  31.08 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4295  flagellar basal body rod protein FlgG  30.35 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50430  flagellar basal body rod protein FlgG  30.35 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185135 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  30.56 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.68 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  30.56 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  31.75 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.19 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  31.62 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  32.28 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.53 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5510  flagellar basal body rod protein FlgG  30.04 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.2 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1007  flagellar basal body rod protein FlgG  30.6 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  30.92 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  30.28 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0823  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.09 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214606  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  29.7 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1506  flagellar basal body rod protein FlgG  28.57 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0523  flagellar basal body rod protein FlgG  31.42 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00648555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  29.28 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  30.33 
 
 		 240 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.17 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3245  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.7 
 
 		 263 aa  101  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3047  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.32 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.517234  normal  0.668581 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1121  flagellar basal body rod protein FlgG  29.96 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  31.08 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  30.71 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  28.24 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3271  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.32 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  30.08 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1383  flagellar basal body rod protein FlgG  29.66 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0644  flagellar basal body rod protein FlgG  30.53 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  30.31 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0222  flagellar basal body rod protein FlgG  30.53 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  30.12 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  30.45 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  30.08 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  30.08 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  30.08 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>