More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3617 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3617  iron-responsive transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  312  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973931  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  92.81 
 
 		 153 aa  293  6e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  91.5 
 
 		 153 aa  290  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0389  iron-responsive transcriptional regulator  79.47 
 
 		 160 aa  243  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00187363  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0421  iron-responsive transcriptional regulator  82.64 
 
 		 160 aa  243  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0531604  hitchhiker  0.00267682 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0838  iron-responsive transcriptional regulator  76.87 
 
 		 156 aa  234  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1445  iron-responsive transcriptional regulator  75.69 
 
 		 153 aa  233  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  77.93 
 
 		 154 aa  233  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  48.57 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.334315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1660  transcriptional regulator  45.14 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278304 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1131  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0968  rrf2 family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.0231013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.58 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0908  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.58 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2888  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1534  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353948  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.32 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2401  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0101  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.59 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1973  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0854  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0962468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1789  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.36 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1812  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.94 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502319  normal  0.154118 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3397  hypothetical protein  43.7 
 
 		 172 aa  116  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1866  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.37 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1690  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968234  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3071  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0569291  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2272  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257031  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2014  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3642  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 163 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  42.65 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  42.65 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  42.36 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  42.65 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1425  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0574582  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  42.65 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  42.65 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2918  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.996999  normal  0.248939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2653  hypothetical protein  43.51 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.87475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0518  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0438222 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1628  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.29 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1327  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 168 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679067  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  41.91 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  41.91 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  38.19 
 
 		 153 aa  111  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0937  transcriptional regulator, TrmB  42.57 
 
 		 175 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3040  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.323158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2375  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 166 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  41.04 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  41.91 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3286  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6231  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1848  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628801  hitchhiker  0.000127972 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2243  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.09 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4279  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1447  Rrf2 family protein  42.75 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0973586  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.26 
 
 		 163 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1758  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 172 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 172 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0763  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.897031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0226  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4066  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4724  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3229  hypothetical protein  39.55 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2865  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.253756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0787  transcriptional repressor NsrR  40.85 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1523  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 181 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1800  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1378  Rrf2 family protein  40.41 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2390  transcriptional regulator  40.41 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2263  putative transcriptional regulator  40.41 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.845273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2135  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1868  Rrf2 family protein  40.41 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2225  Rrf2 family protein  40.41 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.543242  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2204  Rrf2 family protein  40.41 
 
 		 180 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0131831  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0028  Rrf2 family protein  40.41 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.62183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1140  putative transcriptional regulator  40.41 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.155582  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0930  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.81 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1476  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0550713 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2600  hypothetical protein  35.88 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2506  Rrf2 family protein  38.46 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3603  transcriptional repressor NsrR  38.73 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0766  transcriptional repressor NsrR  38.73 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.61103  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5030  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3446  transcriptional repressor NsrR  38.73 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0536  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.315603  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2456  hypothetical protein  35.11 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0788  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4645  transcriptional repressor NsrR  38.03 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4635  transcriptional repressor NsrR  38.03 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4785  transcriptional repressor NsrR  38.03 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.626622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>