More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1572 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  332  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  66.05 
 
 
166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  64.02 
 
 
166 aa  211  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  52.86 
 
 
165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  52.86 
 
 
162 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  52.86 
 
 
162 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  52.86 
 
 
162 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  52.86 
 
 
162 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  49.38 
 
 
164 aa  151  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  49.01 
 
 
162 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  49.01 
 
 
162 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2014  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  51.63 
 
 
156 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1883  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  60.99 
 
 
169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00237919  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50.64 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3397  hypothetical protein  49.38 
 
 
172 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50 
 
 
159 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1327  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.96 
 
 
168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679067  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50.31 
 
 
163 aa  133  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.63 
 
 
150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2401  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48 
 
 
152 aa  130  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0101  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.25 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2506  Rrf2 family protein  46.36 
 
 
150 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  45.99 
 
 
153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  47.76 
 
 
150 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4066  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.97 
 
 
145 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.97 
 
 
145 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0763  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.68 
 
 
175 aa  124  9e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.897031  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3617  iron-responsive transcriptional regulator  48.18 
 
 
153 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973931  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3229  hypothetical protein  47.86 
 
 
144 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0389  iron-responsive transcriptional regulator  50 
 
 
160 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00187363  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0226  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.25 
 
 
162 aa  122  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1476  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.57 
 
 
165 aa  121  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0550713 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  46.72 
 
 
153 aa  121  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0968  rrf2 family transcriptional regulator  51.88 
 
 
157 aa  121  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.0231013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  51.88 
 
 
157 aa  121  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0930  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.61 
 
 
150 aa  121  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0908  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  51.13 
 
 
160 aa  120  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3040  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.71 
 
 
149 aa  121  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.323158 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  46.72 
 
 
153 aa  120  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1973  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.3 
 
 
150 aa  120  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2918  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.79 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.996999  normal  0.248939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3286  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.59 
 
 
142 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0421  iron-responsive transcriptional regulator  49.28 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0531604  hitchhiker  0.00267682 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  48.55 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0518  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 
146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0438222 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4279  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.06 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2653  hypothetical protein  46.9 
 
 
142 aa  117  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.87475  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0937  transcriptional regulator, TrmB  45.14 
 
 
175 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.54 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1758  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.69 
 
 
172 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3071  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.36 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0569291  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3642  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.53 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.69 
 
 
172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  43.28 
 
 
147 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.23 
 
 
171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.87 
 
 
151 aa  114  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.339527  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.48 
 
 
146 aa  114  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.334315 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1690  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.14 
 
 
147 aa  114  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968234  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.48 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628801  hitchhiker  0.000127972 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6231  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.48 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1848  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.48 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1447  Rrf2 family protein  43.84 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0973586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2375  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.43 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1628  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.38 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1425  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.18 
 
 
161 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0574582  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1812  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.32 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502319  normal  0.154118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4724  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.37 
 
 
156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1445  iron-responsive transcriptional regulator  45.99 
 
 
153 aa  111  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0536  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.99 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.315603  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2243  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  48.84 
 
 
140 aa  110  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3815  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.52 
 
 
141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4649  transcriptional repressor NsrR  45.52 
 
 
141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.317237 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4709  transcriptional repressor NsrR  45.52 
 
 
141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0838  iron-responsive transcriptional regulator  45.65 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0043  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.22 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000767573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.22 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0043  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.22 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0465453  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2272  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.21 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257031  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.22 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.312159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4221  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.97 
 
 
149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1866  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.14 
 
 
154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0361  transcriptional repressor NsrR  44.36 
 
 
141 aa  107  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2600  hypothetical protein  36.5 
 
 
143 aa  107  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2456  hypothetical protein  35.92 
 
 
143 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1131  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.36 
 
 
144 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.28 
 
 
151 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.370774  hitchhiker  0.00270297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04045  predicted DNA-binding transcriptional regulator  44.78 
 
 
141 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5694  transcriptional repressor NsrR  44.78 
 
 
141 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2888  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.36 
 
 
144 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5030  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.39 
 
 
145 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4421  transcriptional repressor NsrR  44.78 
 
 
141 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4881  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.58 
 
 
152 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4737  transcriptional repressor NsrR  44.78 
 
 
141 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1534  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.36 
 
 
144 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353948  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04007  hypothetical protein  44.78 
 
 
141 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.7208  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3835  transcriptional repressor NsrR  44.78 
 
 
141 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.678572  hitchhiker  0.00000129464 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0045  Rrf2 family protein  37.91 
 
 
151 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0640  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.86 
 
 
149 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0041  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.58 
 
 
151 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0191012  hitchhiker  0.000277794 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0047  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.58 
 
 
151 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000883142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>