59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1387 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  90.83 
 
 
438 aa  825    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  75.11 
 
 
439 aa  684    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  100 
 
 
438 aa  893    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  90.37 
 
 
438 aa  820    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  72.94 
 
 
439 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  66.06 
 
 
441 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  62.79 
 
 
443 aa  556  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  38.52 
 
 
430 aa  311  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  32.26 
 
 
430 aa  256  5e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  35.65 
 
 
453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  35.76 
 
 
449 aa  239  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  36.3 
 
 
449 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  36.3 
 
 
449 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.05 
 
 
437 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  34.88 
 
 
437 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  34.03 
 
 
437 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  32.79 
 
 
446 aa  216  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  35.28 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  35.09 
 
 
455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  32.21 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  32.16 
 
 
446 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  32.51 
 
 
451 aa  209  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  33.64 
 
 
435 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  35.21 
 
 
434 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  30.34 
 
 
453 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  34.01 
 
 
441 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  32.57 
 
 
445 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  32.71 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  33.41 
 
 
452 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 
453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  32.63 
 
 
454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  32.94 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  29.77 
 
 
446 aa  196  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  32.87 
 
 
452 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  31.88 
 
 
429 aa  196  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  30.37 
 
 
458 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  32.18 
 
 
418 aa  186  6e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  31.95 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 
450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  34.67 
 
 
424 aa  176  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  29.58 
 
 
456 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  28.39 
 
 
377 aa  121  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  26.99 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  25.77 
 
 
467 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  26.37 
 
 
396 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  27.92 
 
 
440 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  30.56 
 
 
437 aa  53.9  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  30.56 
 
 
437 aa  53.9  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  29.17 
 
 
435 aa  50.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  28.47 
 
 
439 aa  49.7  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  27.45 
 
 
443 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  26.39 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  27.97 
 
 
443 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  27.78 
 
 
443 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  27.97 
 
 
436 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  26.39 
 
 
434 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  26.8 
 
 
434 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  28.47 
 
 
440 aa  43.5  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  27.56 
 
 
442 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>