More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0011 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 
185 aa  374  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  59.79 
 
 
188 aa  207  9e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  54.59 
 
 
172 aa  186  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  52.79 
 
 
187 aa  182  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  53.23 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  53.51 
 
 
166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  51.3 
 
 
172 aa  170  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  50.54 
 
 
173 aa  168  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  49.46 
 
 
164 aa  167  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 
173 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 
173 aa  166  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 
173 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 
173 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  49.19 
 
 
164 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  50.27 
 
 
172 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  57.66 
 
 
138 aa  165  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  49.73 
 
 
172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  49.73 
 
 
172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  50.54 
 
 
170 aa  164  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  50.54 
 
 
164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  50.27 
 
 
169 aa  161  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  56.2 
 
 
138 aa  159  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  46.24 
 
 
141 aa  154  9e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  45.7 
 
 
169 aa  142  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  59.09 
 
 
119 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  41.62 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  41.62 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  41.62 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  41.62 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  59.43 
 
 
142 aa  134  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  59.43 
 
 
142 aa  134  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  47.79 
 
 
137 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  41.62 
 
 
167 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  41.62 
 
 
167 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  40.96 
 
 
156 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  63.81 
 
 
148 aa  129  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  43.11 
 
 
154 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  57.28 
 
 
114 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  50.93 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 
111 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 
112 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 
112 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 
112 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  51.85 
 
 
111 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  51.85 
 
 
111 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  43.42 
 
 
156 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  49.07 
 
 
112 aa  124  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  47.41 
 
 
150 aa  124  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  50.93 
 
 
111 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  50.93 
 
 
121 aa  122  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 
112 aa  121  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  54.81 
 
 
133 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  51.92 
 
 
140 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  47.93 
 
 
150 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  52.88 
 
 
136 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  49.04 
 
 
142 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  50.96 
 
 
139 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  44.14 
 
 
142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  48.08 
 
 
148 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  44.64 
 
 
130 aa  106  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  49.04 
 
 
138 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  49.04 
 
 
140 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  43.75 
 
 
131 aa  102  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  47.22 
 
 
136 aa  99.4  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  42.72 
 
 
114 aa  99.4  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  42.72 
 
 
114 aa  99.4  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  44.76 
 
 
129 aa  97.8  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0438  single-stranded DNA-binding protein  41.59 
 
 
129 aa  97.1  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000830836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  38.33 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  37.14 
 
 
154 aa  95.1  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  45.37 
 
 
146 aa  94.4  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  40.38 
 
 
157 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  37.7 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  43.27 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  42.99 
 
 
161 aa  92.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  37.5 
 
 
125 aa  92  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  37.5 
 
 
125 aa  92  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  36.67 
 
 
174 aa  92  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  41.12 
 
 
141 aa  91.7  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  31.41 
 
 
160 aa  91.3  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  38.81 
 
 
150 aa  90.5  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  38.81 
 
 
150 aa  90.5  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  32.43 
 
 
151 aa  89.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  41.12 
 
 
156 aa  89.4  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  42.27 
 
 
134 aa  89.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  38.64 
 
 
143 aa  89  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  38.46 
 
 
149 aa  88.6  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  33.1 
 
 
139 aa  87.8  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  39.42 
 
 
167 aa  87.8  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  31.55 
 
 
172 aa  87.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  40 
 
 
166 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  38.98 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  38.89 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  37.5 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  36.64 
 
 
146 aa  86.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  32.41 
 
 
139 aa  85.9  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  30.89 
 
 
177 aa  85.9  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  39.42 
 
 
146 aa  85.5  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  32.81 
 
 
161 aa  85.5  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  32.41 
 
 
139 aa  85.5  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>