73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2005 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  100 
 
 		 262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  81.51 
 
 		 269 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  49.8 
 
 		 274 aa  248  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  30.93 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  30.41 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  34 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  33.13 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4524  abortive infection protein  35.35 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2783  Abortive infection protein  33.68 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  0.142133 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  38.04 
 
 		 234 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  31.71 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  27.61 
 
 		 297 aa  52  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  27.74 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  34.78 
 
 		 140 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  27.74 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  33.94 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  28.14 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  34.78 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  34.78 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  31.58 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2888  Abortive infection protein  34.88 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2661  abortive infection protein  34.88 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.612389 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  30.43 
 
 		 420 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  39.24 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  25.98 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  32 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  39.24 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  22.73 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  29.05 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  39.24 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  21.99 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  29.05 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  29.05 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0019  Abortive infection protein  28.33 
 
 		 302 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  30.19 
 
 		 333 aa  46.6  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3241  Abortive infection protein  34.48 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  28.44 
 
 		 321 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  45.8  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  22.22 
 
 		 337 aa  45.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  28.66 
 
 		 246 aa  45.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  23.78 
 
 		 237 aa  45.4  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  27.91 
 
 		 280 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  34.44 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  38.46 
 
 		 264 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  35.42 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  25.16 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  23.84 
 
 		 337 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  32.5 
 
 		 399 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  22.41 
 
 		 346 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2540  abortive infection protein  21.83 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.456595  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  21.72 
 
 		 337 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  31.58 
 
 		 602 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  32.63 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  31.91 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 337 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  27.2 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 337 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  31.07 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  31.96 
 
 		 227 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  31.43 
 
 		 176 aa  43.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  21.72 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0699  abortive infection protein  35.44 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  33.33 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  26.53 
 
 		 227 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  21.72 
 
 		 337 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  27.21 
 
 		 448 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  27.21 
 
 		 448 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2649  abortive infection protein  32.71 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  30.86 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  28.26 
 
 		 775 aa  42.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 337 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  26.58 
 
 		 232 aa  42.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  32.91 
 
 		 317 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>