27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2888 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2888  Abortive infection protein  100 
 
 		 272 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2661  abortive infection protein  99.26 
 
 		 272 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.612389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2783  Abortive infection protein  86.18 
 
 		 275 aa  421  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  0.142133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4524  abortive infection protein  52.85 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  51.06 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0698  Abortive infection protein  42.05 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  41.86 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  34.88 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  33.72 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  34.48 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  38.83 
 
 		 420 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  35.16 
 
 		 333 aa  50.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  35.87 
 
 		 448 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  35.87 
 
 		 448 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  40.23 
 
 		 319 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  37.36 
 
 		 453 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  35.42 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  31.58 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  31.78 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  36.56 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0827934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  35.05 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  30.84 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  33.72 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  34.12 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  26 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  34.12 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2393  abortive infection protein  37.62 
 
 		 159 aa  42.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000919744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>