67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1170 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_21070  cobalamin B12-binding domain protein  69.96 
 
 		 730 aa  1058    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1170  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  100 
 
 		 745 aa  1538    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000101599  decreased coverage  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1481  cobalamin B12-binding domain-containing protein  70.52 
 
 		 734 aa  1090    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00108773  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1170  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  60.77 
 
 		 732 aa  927    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.88369  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1642  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.66 
 
 		 733 aa  956    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0909  cobalamin B12-binding domain-containing protein  65.09 
 
 		 728 aa  954    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0203  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  29.06 
 
 		 516 aa  146  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.3169  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1073  D-lysine 5,6-aminomutase, alpha subunit  29.89 
 
 		 523 aa  144  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.720029 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1084  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  27.32 
 
 		 518 aa  140  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0196  D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  28.22 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3888  D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  26.98 
 
 		 518 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1906  beta-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit, D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  28.26 
 
 		 523 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1074  D-lysine 5,6-aminomutase, beta subunit  34.23 
 
 		 263 aa  117  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.439599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3950  D-Lysine 56-aminomutase subunit alpha  27.64 
 
 		 525 aa  117  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3887  cobalamin B12-binding  33.94 
 
 		 251 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0202  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 261 aa  111  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0222678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2349  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  26.46 
 
 		 523 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320388  normal  0.0638 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2472  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  26.92 
 
 		 524 aa  111  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2384  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  26.92 
 
 		 524 aa  111  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1905  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit, D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  32.38 
 
 		 246 aa  109  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1483  beta-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit / D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  26.63 
 
 		 524 aa  108  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584517  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0197  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.94 
 
 		 261 aa  107  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1085  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.88 
 
 		 265 aa  107  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2384  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  27.63 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0224895  hitchhiker  0.00032654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2265  hypothetical protein  27.37 
 
 		 520 aa  106  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00000065205  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2663  D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit / beta-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  25 
 
 		 526 aa  101  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3949  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.34 
 
 		 248 aa  99.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2664  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  32.22 
 
 		 251 aa  95.5  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438749  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2347  cobalamin B12-binding domain protein  33.2 
 
 		 267 aa  90.9  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2385  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.79 
 
 		 254 aa  90.1  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00814735  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2266  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.6 
 
 		 260 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220263  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2470  cobalamin B12-binding domain protein  31.66 
 
 		 255 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2382  cobalamin B12-binding domain protein  31.66 
 
 		 255 aa  85.9  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1485  D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  32.16 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.746586  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2347  cobalamin vitamin B12-binding protein  32.16 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131121  normal  0.450536 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 218 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 219 aa  55.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.88 
 
 		 219 aa  55.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0752  methylaspartate mutase subunit S  31.67 
 
 		 149 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 219 aa  53.9  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0832  methylaspartate mutase subunit S  30.83 
 
 		 149 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  30.89 
 
 		 216 aa  50.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1023  methylaspartate mutase subunit S  30.91 
 
 		 139 aa  50.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0266173  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15460  methylaspartate mutase subunit S  31.15 
 
 		 146 aa  48.9  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.68 
 
 		 133 aa  48.9  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2692  methylaspartate mutase subunit S  32.29 
 
 		 144 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  31.82 
 
 		 210 aa  48.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  31.25 
 
 		 158 aa  48.1  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  31.78 
 
 		 139 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  28.35 
 
 		 841 aa  47.4  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  35.38 
 
 		 219 aa  47.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  30.71 
 
 		 217 aa  47.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  30.91 
 
 		 251 aa  47.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  32.43 
 
 		 259 aa  46.6  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  30.91 
 
 		 168 aa  46.6  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2332  methylmalonyl-CoA mutase  31.07 
 
 		 1146 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4403  methylaspartate mutase subunit S  29.75 
 
 		 136 aa  45.8  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  31.54 
 
 		 804 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  35.05 
 
 		 1239 aa  45.4  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  31.86 
 
 		 218 aa  45.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  32 
 
 		 212 aa  44.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  28.79 
 
 		 224 aa  44.3  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0082  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.35 
 
 		 541 aa  44.3  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.566205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  31.2 
 
 		 800 aa  44.3  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  24.34 
 
 		 1226 aa  44.3  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3334  methylaspartate mutase, S subunit  30.77 
 
 		 151 aa  44.3  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1594  methylaspartate mutase, S subunit  31.68 
 
 		 146 aa  43.9  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>