159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4836 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008697  Noca_4836  D-cysteine desulfhydrase  100 
 
 
322 aa  635    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4819  D-cysteine desulfhydrase  72.05 
 
 
322 aa  448  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5055  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  45.09 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0798685  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4875  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  44.31 
 
 
331 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338198  normal  0.0605398 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0310  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  34.91 
 
 
335 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1185  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  39.63 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0389534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  39.08 
 
 
330 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1828  D-cysteine desulfhydrase  37.08 
 
 
340 aa  194  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2010  D-cysteine desulfhydrase  40.56 
 
 
334 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152874  decreased coverage  0.00891545 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1604  D-cysteine desulfhydrase  36.86 
 
 
340 aa  193  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.033923  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  38.77 
 
 
328 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  38.77 
 
 
328 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  38.77 
 
 
328 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  38.77 
 
 
328 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5179  pyridoxal phosphate-dependent deaminase, putative  41.36 
 
 
332 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2109  D-cysteine desulfhydrase  38.77 
 
 
328 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497431  normal  0.0120182 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3094  D-cysteine desulfhydrase  41.82 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3006  D-cysteine desulfhydrase  41.82 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3059  D-cysteine desulfhydrase  41.82 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1439  D-cysteine desulfhydrase  39.33 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457826  normal  0.632152 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2137  D-cysteine desulfhydrase  41.82 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0774  D-cysteine desulfhydrase  41.82 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2607  D-cysteine desulfhydrase  41.82 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2006  D-cysteine desulfhydrase  41.82 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277685  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0359  D-cysteine desulfhydrase  40.43 
 
 
332 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1727  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  37.23 
 
 
328 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00524906  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1047  D-cysteine desulfhydrase  37.23 
 
 
328 aa  182  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1263  D-cysteine desulfhydrase  37.23 
 
 
328 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0547515  normal  0.0193238 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1720  D-cysteine desulfhydrase  37.23 
 
 
328 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.628209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2153  D-cysteine desulfhydrase  37.23 
 
 
342 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0177604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2018  D-cysteine desulfhydrase  37.23 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0820004  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2693  D-cysteine desulfhydrase  36.92 
 
 
328 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102426  normal  0.0614251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  35.87 
 
 
334 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3582  D-cysteine desulfhydrase  41.25 
 
 
338 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  35.56 
 
 
334 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  37.15 
 
 
334 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5532  D-cysteine desulfhydrase  36.78 
 
 
343 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.1518 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  34.86 
 
 
331 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6848  D-cysteine desulfhydrase  37.39 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368469 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  34.15 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  34.56 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2515  D-cysteine desulfhydrase  41.44 
 
 
340 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2275  D-cysteine desulfhydrase  37.54 
 
 
330 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2030  D-cysteine desulfhydrase  37.42 
 
 
339 aa  172  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2377  D-cysteine desulfhydrase  37.54 
 
 
339 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  34.15 
 
 
331 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0604  D-cysteine desulfhydrase  36.14 
 
 
332 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0934  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.58 
 
 
338 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  33.85 
 
 
331 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  33.85 
 
 
331 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  33.85 
 
 
331 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  36.56 
 
 
330 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  34.77 
 
 
331 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1836  D-cysteine desulfhydrase  35.74 
 
 
332 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3180  D-cysteine desulfhydrase  36.86 
 
 
333 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  34.46 
 
 
331 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1784  D-cysteine desulfhydrase  34.34 
 
 
332 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2581  D-cysteine desulfhydrase  35.89 
 
 
333 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525939  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0339  D-cysteine desulfhydrase  35.56 
 
 
333 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0969391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  33.23 
 
 
331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2506  D-cysteine desulfhydrase  36.84 
 
 
361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  0.820205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  36.2 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2357  D-cysteine desulfhydrase  40.24 
 
 
335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.344749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2636  D-cysteine desulfhydrase  40.24 
 
 
335 aa  162  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2876  D-cysteine desulfhydrase  38.53 
 
 
342 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247142  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1802  D-cysteine desulfhydrase  34.24 
 
 
337 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1404  D-cysteine desulfhydrase  33.94 
 
 
337 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2314  D-cysteine desulfhydrase  40.06 
 
 
335 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1663  D-cysteine desulfhydrase  34.17 
 
 
336 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000049313  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1301  D-cysteine desulfhydrase  36.5 
 
 
336 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28382  predicted protein  37.04 
 
 
365 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226671  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5685  D-cysteine desulfhydrase  39.33 
 
 
337 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104334 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1432  D-cysteine desulfhydrase  41.74 
 
 
340 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.189366  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2828  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  35.17 
 
 
335 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  normal  0.0222405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2428  D-cysteine desulfhydrase  41.74 
 
 
340 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.551753  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6869  D-cysteine desulfhydrase  36.67 
 
 
359 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5266  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, D- cysteine desulfhydrase family  36.94 
 
 
337 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  34.7 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  34.7 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0941  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.13 
 
 
335 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0697  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.44 
 
 
343 aa  145  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00190  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  31.8 
 
 
345 aa  142  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000288406  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5155  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.54 
 
 
338 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331859  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2860  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.54 
 
 
338 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2397  D-cysteine desulfhydrase  36.42 
 
 
337 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1412  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  35.78 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322961  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2169  D-cysteine desulfhydrase  35.5 
 
 
345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3308  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  32.93 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.0253505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4142  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.23 
 
 
338 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.77171  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5215  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.23 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7821  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  32.93 
 
 
338 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5405  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  32.62 
 
 
338 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.828504 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4794  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  32.93 
 
 
338 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3374  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  32.93 
 
 
338 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3623  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  32.32 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3828  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  32.01 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.961032  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0271  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.13 
 
 
337 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5397  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  32.01 
 
 
338 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0993744  normal  0.0379152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3150  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.03 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.768624  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6456  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  32.13 
 
 
339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.379637 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>