82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4459 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4459  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0891  carboxymuconolactone decarboxylase  71.63 
 
 		 218 aa  298  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.911286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.62 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  28.04 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3968  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.02 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  28.91 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  28.91 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.97 
 
 		 145 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1026  carboxymuconolactone decarboxylase  27.75 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4247  hypothetical protein  32.41 
 
 		 170 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.57 
 
 		 143 aa  52  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.57 
 
 		 143 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.22 
 
 		 151 aa  51.6  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1900  carboxymuconolactone decarboxylase  27.06 
 
 		 173 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.429889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.42 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3320  carboxymuconolactone decarboxylase  27.52 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0893741  normal  0.0464114 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  25.42 
 
 		 145 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  26.17 
 
 		 145 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  30.22 
 
 		 151 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.12 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.58 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  24.58 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  26.99 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  26.72 
 
 		 143 aa  48.9  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  25.23 
 
 		 145 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0598  putative carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 169 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17953  normal  0.124387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2761  carboxymuconolactone decarboxylase  22.64 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  24.3 
 
 		 145 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3802  hypothetical protein  31.52 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.639259  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.05 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  24.59 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  24.32 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.43 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.58 
 
 		 145 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  23.73 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  30.97 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3041  carboxymuconolactone decarboxylase  26.36 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0701219  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  28.7 
 
 		 157 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  26.39 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  28.7 
 
 		 157 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.21 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.58 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.53 
 
 		 182 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.53 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.53 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  31.53 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.53 
 
 		 182 aa  45.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  31.53 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5963  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.91 
 
 		 159 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.899635  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  31.53 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  29.46 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25 
 
 		 283 aa  45.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  26.28 
 
 		 509 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  24.59 
 
 		 145 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  26.67 
 
 		 145 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4101  alkylhydroperoxidase  29.17 
 
 		 143 aa  45.1  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.63 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.81 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3596  hypothetical protein  28.19 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  28.3 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  27.43 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  25.71 
 
 		 153 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.58 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.97 
 
 		 152 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.37 
 
 		 152 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1184  alkylhydroperoxidase  25.23 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  23.26 
 
 		 156 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  25 
 
 		 157 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.17 
 
 		 150 aa  42  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.17 
 
 		 150 aa  42  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.68 
 
 		 155 aa  42  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.17 
 
 		 150 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.17 
 
 		 150 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  24.17 
 
 		 145 aa  42  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.17 
 
 		 150 aa  42  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3171  carboxymuconolactone decarboxylase  22.66 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  25.41 
 
 		 145 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  24.3 
 
 		 145 aa  42  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.17 
 
 		 150 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12336  hypothetical protein  30.43 
 
 		 284 aa  41.6  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.55 
 
 		 159 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  26.55 
 
 		 159 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>