More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3884 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  100 
 
 
191 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  62.03 
 
 
193 aa  230  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  58.15 
 
 
191 aa  224  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  60.33 
 
 
201 aa  224  9e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  57.07 
 
 
192 aa  217  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  58.7 
 
 
192 aa  216  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  57.61 
 
 
192 aa  216  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  57.84 
 
 
197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  59.24 
 
 
205 aa  214  4e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  58.7 
 
 
184 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0648  adenylate kinase  58.7 
 
 
211 aa  210  7.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  53.51 
 
 
189 aa  209  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  56.45 
 
 
192 aa  209  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  55.91 
 
 
181 aa  206  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29530  Adenylate kinase  57.22 
 
 
194 aa  206  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.754676  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  54.59 
 
 
183 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0608  adenylate kinase  53.44 
 
 
195 aa  197  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  51.42 
 
 
217 aa  193  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  45.25 
 
 
225 aa  193  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  51.35 
 
 
184 aa  192  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  52.85 
 
 
204 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  49.46 
 
 
186 aa  191  4e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0631  adenylate kinase  50.27 
 
 
197 aa  191  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1728  adenylate kinase  50 
 
 
186 aa  191  7e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0507539  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  51.89 
 
 
181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  51.89 
 
 
181 aa  188  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  51.89 
 
 
181 aa  188  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  51.89 
 
 
181 aa  188  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  57.3 
 
 
181 aa  187  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  49.73 
 
 
187 aa  187  7e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  50 
 
 
217 aa  187  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  51.89 
 
 
181 aa  187  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  49.73 
 
 
187 aa  187  8e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  49.53 
 
 
217 aa  187  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  47.17 
 
 
217 aa  184  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  46.7 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  49.53 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  46.7 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  49.06 
 
 
217 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  50.27 
 
 
187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  45.58 
 
 
219 aa  179  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  46.49 
 
 
187 aa  178  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2213  adenylate kinase  49.46 
 
 
186 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  47.39 
 
 
216 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  49.2 
 
 
199 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  47.4 
 
 
200 aa  175  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  48.37 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  47.92 
 
 
200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  44.81 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  43.55 
 
 
367 aa  172  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  48.13 
 
 
194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  41.98 
 
 
217 aa  171  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  46.6 
 
 
193 aa  171  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  45.28 
 
 
217 aa  171  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  41.51 
 
 
216 aa  170  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  41.51 
 
 
216 aa  170  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  43.87 
 
 
215 aa  169  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  47.12 
 
 
193 aa  169  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  48.17 
 
 
192 aa  168  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2993  adenylate kinase  45.6 
 
 
191 aa  169  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0710  adenylate kinase  47.28 
 
 
184 aa  168  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000807977  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  47.22 
 
 
182 aa  167  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  44.32 
 
 
195 aa  167  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  41.98 
 
 
423 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2578  adenylate kinase  47.78 
 
 
184 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  44.67 
 
 
200 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  43.87 
 
 
217 aa  166  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  47.06 
 
 
195 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  42.92 
 
 
216 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  41.98 
 
 
214 aa  165  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  40.57 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  42.47 
 
 
374 aa  165  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  44.16 
 
 
200 aa  165  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  41.59 
 
 
214 aa  165  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1937  adenylate kinase  47.31 
 
 
199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  46.84 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  45.88 
 
 
367 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1111  adenylate kinase  41.36 
 
 
216 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4111  adenylate kinase  41.36 
 
 
216 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  41.55 
 
 
213 aa  161  7e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  44.62 
 
 
188 aa  161  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  45.5 
 
 
194 aa  160  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  42.45 
 
 
214 aa  160  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0420  adenylate kinase  43.32 
 
 
190 aa  160  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  45.5 
 
 
194 aa  160  9e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  47.51 
 
 
195 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  44.85 
 
 
341 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  45.31 
 
 
205 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  40.09 
 
 
218 aa  160  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1506  adenylate kinase  40.91 
 
 
216 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.614097  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  44.02 
 
 
213 aa  159  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4216  adenylate kinase  40.91 
 
 
216 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3722  adenylate kinase  45.25 
 
 
187 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  43.81 
 
 
309 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  40.38 
 
 
219 aa  159  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  42.45 
 
 
214 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  38.86 
 
 
215 aa  159  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  40.57 
 
 
216 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  41.98 
 
 
214 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  41.07 
 
 
221 aa  158  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>