66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3861 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
541 aa  1076    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  42.59 
 
 
539 aa  361  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  42.88 
 
 
544 aa  350  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  38.53 
 
 
553 aa  343  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  40.67 
 
 
547 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  37.97 
 
 
638 aa  324  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  39.55 
 
 
531 aa  324  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  39.43 
 
 
541 aa  320  3.9999999999999996e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
567 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
528 aa  320  5e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  37.52 
 
 
573 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  38.04 
 
 
520 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  37.79 
 
 
586 aa  310  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 
569 aa  309  6.999999999999999e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  39.11 
 
 
584 aa  309  6.999999999999999e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  38.52 
 
 
592 aa  309  8e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  37.88 
 
 
538 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 
534 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  38.01 
 
 
539 aa  302  8.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  39.96 
 
 
508 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  34.79 
 
 
523 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  39.35 
 
 
579 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 
493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 
493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 
493 aa  273  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  38.11 
 
 
560 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  34.19 
 
 
559 aa  266  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  40.08 
 
 
563 aa  263  8e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 
516 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  35.93 
 
 
585 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  36.82 
 
 
555 aa  258  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  34.28 
 
 
522 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  32.9 
 
 
511 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  36.21 
 
 
537 aa  251  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 
525 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  37.55 
 
 
507 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  33.46 
 
 
572 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  31.21 
 
 
528 aa  226  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  33.2 
 
 
534 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  27.36 
 
 
441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  21.02 
 
 
658 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  21.26 
 
 
968 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.92 
 
 
447 aa  91.7  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  21.27 
 
 
493 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  22.18 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  24.02 
 
 
462 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
439 aa  74.3  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  21.09 
 
 
487 aa  73.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  23.13 
 
 
566 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  22.22 
 
 
466 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0961  conserved hypothetical protein  29.86 
 
 
372 aa  64.7  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  21.74 
 
 
469 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  21.22 
 
 
469 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3252  glycosyl transferase family 39  29.17 
 
 
522 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2869  glycosyl transferase family 39  29.17 
 
 
522 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0447081  normal  0.0253035 
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  26.58 
 
 
918 aa  52  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01240  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  22.19 
 
 
767 aa  50.8  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139525  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0600  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
387 aa  50.8  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1040  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
448 aa  50.4  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000509262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  25.98 
 
 
444 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1651  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
384 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00693966 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  29.92 
 
 
563 aa  47.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.92 
 
 
563 aa  47.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1534  putative glycosyltransferase  29.45 
 
 
532 aa  44.3  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1992  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
387 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.553318  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  21.86 
 
 
780 aa  43.5  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>