67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1310 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1310  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  100 
 
 
152 aa  309  7.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0381  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  73.94 
 
 
144 aa  203  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0397123  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1356  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  76.87 
 
 
157 aa  202  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2370  Mov34/MPN/PAD-1  70.83 
 
 
135 aa  201  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1689  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  68.87 
 
 
148 aa  201  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00143204  hitchhiker  0.00000496808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0313  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  67.13 
 
 
137 aa  194  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3873  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  68.75 
 
 
137 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  66.89 
 
 
152 aa  192  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1725  Mov34/MPN/PAD-1  68.31 
 
 
138 aa  189  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  0.175061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5654  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  65.73 
 
 
148 aa  187  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0866  Mov34/MPN/PAD-1  67.83 
 
 
134 aa  187  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0936  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  66.67 
 
 
137 aa  184  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.73483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1289  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  63.64 
 
 
141 aa  183  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1965  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  64.79 
 
 
135 aa  181  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1009  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  63.33 
 
 
151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0989  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  66.67 
 
 
162 aa  179  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397088  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3836  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  65.28 
 
 
137 aa  178  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.818865  normal  0.112998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3924  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  65.28 
 
 
137 aa  178  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3850  Mov34/MPN/PAD-1  65.28 
 
 
137 aa  178  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2352  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  63.45 
 
 
137 aa  176  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3009  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1100  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  65.97 
 
 
162 aa  176  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.952576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4293  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  66.92 
 
 
137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.454814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1696  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  62.24 
 
 
136 aa  168  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0603262  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1539  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  58.91 
 
 
145 aa  152  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0971  Mov34/MPN/PAD-1  52.78 
 
 
159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1850  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  40.43 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  36.11 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0646  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.99 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  30.61 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.43 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  39.25 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.51 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.65 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.79 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.1 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.51 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.42 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.27 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  29.71 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1268  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.82 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.32 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.19 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.73 
 
 
138 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  24.26 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  29.41 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.17 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  27.97 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  32.74 
 
 
256 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.68 
 
 
134 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  24.66 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.82 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  29.66 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  30.97 
 
 
256 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  34.95 
 
 
245 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2183  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.22 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206929 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  33.98 
 
 
245 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  34.62 
 
 
247 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  34.62 
 
 
247 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  33.65 
 
 
247 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  34.62 
 
 
247 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  34.62 
 
 
247 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0648  hypothetical protein  24.84 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.635682  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0529  hypothetical protein  28.33 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2119  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.21 
 
 
128 aa  41.2  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  33.65 
 
 
247 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  32.69 
 
 
247 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  31.53 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.180806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>