55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1035 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1035  nitroreductase  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5999  nitroreductase  54.46 
 
 		 218 aa  204  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  22.83 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  23.73 
 
 		 177 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  22.55 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  23.15 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  42.19 
 
 		 171 aa  52  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  38.67 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  24.08 
 
 		 180 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  28.42 
 
 		 173 aa  49.3  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  37.66 
 
 		 189 aa  48.5  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  26.9 
 
 		 189 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.69 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.45 
 
 		 174 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  47.92 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  26.57 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  35.19 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  24.75 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  33.33 
 
 		 183 aa  45.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  42.37 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  32.22 
 
 		 166 aa  45.8  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  24.06 
 
 		 189 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  38.71 
 
 		 165 aa  45.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1889  nitroreductase  28.95 
 
 		 261 aa  45.4  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.847236  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  25.31 
 
 		 169 aa  45.4  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  36.21 
 
 		 178 aa  45.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  46.94 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  31.94 
 
 		 201 aa  45.4  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  24.76 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  26.99 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  41.43 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  32.43 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0330  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.75 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.3 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  43.64 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  39.62 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  43.64 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  24.7 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  23.32 
 
 		 163 aa  42.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  25.31 
 
 		 169 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  23.04 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  43.64 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  43.64 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  43.64 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  43.64 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  42.86 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  26.86 
 
 		 188 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  43.64 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  43.64 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  33.82 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.61 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  31.48 
 
 		 218 aa  42  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1902  nitroreductase  26.91 
 
 		 261 aa  42  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.453048  hitchhiker  0.00100837 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  37.74 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  23.61 
 
 		 183 aa  41.6  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>