25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0723 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 362 aa  740    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  38.14 
 
 		 533 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  34.99 
 
 		 525 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  25.15 
 
 		 1194 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  26.8 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  25.33 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  22.97 
 
 		 717 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  24.57 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  33.62 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  28.39 
 
 		 709 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  34.21 
 
 		 635 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  27.5 
 
 		 376 aa  50.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  24.58 
 
 		 626 aa  50.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  25.17 
 
 		 336 aa  49.7  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  25 
 
 		 651 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  24.15 
 
 		 703 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  31.18 
 
 		 542 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 		 563 aa  46.6  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01285  Endo-beta-1,4-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDU5]  29.52 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  24.53 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  25.59 
 
 		 347 aa  44.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  22.82 
 
 		 400 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  22.5 
 
 		 1004 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  25.86 
 
 		 539 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  25.17 
 
 		 349 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>