49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0694 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 81 aa  160  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  60.38 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  52.38 
 
 		 82 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  48.75 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  48.39 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  48.84 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  50.79 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  43.94 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  47.27 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  47.22 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  45.95 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  48.28 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  52.83 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  46.3 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  43.84 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  50.91 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  43.64 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  56.14 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  46.03 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  47.83 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  50.7 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  50.88 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  32.73 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  48.94 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 210 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  45.45 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  48.39 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  54.1 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  40.38 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  46.27 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  32 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  52.83 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  39.29 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  30.67 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  35.42 
 
 		 80 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  42.11 
 
 		 79 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  37.78 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  37.78 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  35.21 
 
 		 86 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2728  preprotein translocase subunit SecE  36.07 
 
 		 74 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000036945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>