219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1968 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1968  UbiE/COQ5 methyltransferase  100 
 
 		 698 aa  1432    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 225 aa  65.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2106  methyltransferase type 12  27.05 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 1509 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0120  Methyltransferase type 12  27.5 
 
 		 619 aa  61.6  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561606  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.09 
 
 		 1561 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 239 aa  59.7  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1453  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.53 
 
 		 246 aa  59.7  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00782533  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  29.59 
 
 		 266 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 290 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.33 
 
 		 233 aa  57  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 237 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.74 
 
 		 263 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 240 aa  55.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.14 
 
 		 279 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 207 aa  55.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 268 aa  54.7  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 207 aa  54.7  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2399  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 		 996 aa  54.3  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.969384  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  28.63 
 
 		 252 aa  54.3  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 208 aa  54.3  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  26.38 
 
 		 255 aa  53.9  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.79 
 
 		 248 aa  53.9  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.72 
 
 		 236 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  31.47 
 
 		 263 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.82 
 
 		 234 aa  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  26.94 
 
 		 417 aa  52.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 328 aa  51.6  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 207 aa  52  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2480  hypothetical protein  23.42 
 
 		 407 aa  51.6  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.400243  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2663  hypothetical protein  23.42 
 
 		 407 aa  51.6  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.87 
 
 		 213 aa  51.6  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 354 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2678  hypothetical protein  23.42 
 
 		 434 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000191981 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 268 aa  51.2  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 349 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  37.5 
 
 		 268 aa  50.8  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2411  MerR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 434 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 267 aa  50.8  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 1171 aa  50.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2442  MerR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 434 aa  50.8  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000095607  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 270 aa  50.8  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 205 aa  50.8  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.37 
 
 		 243 aa  50.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 342 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.97 
 
 		 265 aa  50.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0649  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.37 
 
 		 243 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  28.35 
 
 		 192 aa  50.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 186 aa  50.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 255 aa  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  21.3 
 
 		 279 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0166  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.33 
 
 		 239 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 305 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  32.58 
 
 		 253 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 261 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 274 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 275 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 341 aa  50.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  29.2 
 
 		 255 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.27 
 
 		 272 aa  49.3  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 209 aa  49.7  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 260 aa  49.7  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 265 aa  48.9  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 256 aa  48.9  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.26 
 
 		 275 aa  48.9  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_4846  predicted protein  28.57 
 
 		 218 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 264 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0186  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 		 243 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 200 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0844  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 		 243 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 348 aa  48.5  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  32.88 
 
 		 225 aa  48.9  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 		 243 aa  48.5  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2760  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 		 243 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793539  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 		 243 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605839  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 200 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0667  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 		 243 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0683  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 		 243 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 		 243 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0764  Methyltransferase type 11  40.48 
 
 		 301 aa  48.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0360  aminoglycoside phosphotransferase  23.35 
 
 		 576 aa  48.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  27.33 
 
 		 240 aa  48.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2650  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 243 aa  48.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.067766  normal  0.282604 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 243 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184412  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2783  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 243 aa  48.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 243 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  39.77 
 
 		 258 aa  48.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2759  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 243 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 265 aa  47.8  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0374  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.37 
 
 		 243 aa  48.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  31.97 
 
 		 231 aa  48.1  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 261 aa  48.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 273 aa  48.1  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 188 aa  47.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 267 aa  47.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 		 1106 aa  47.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  26.72 
 
 		 258 aa  47.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  40.26 
 
 		 207 aa  47.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>