35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1798 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1049    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  58.55 
 
 		 491 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  51.51 
 
 		 505 aa  508  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  51.23 
 
 		 515 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  42.3 
 
 		 622 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  41.04 
 
 		 477 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  41.39 
 
 		 628 aa  351  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  39.48 
 
 		 483 aa  343  5e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  37.4 
 
 		 492 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  37.74 
 
 		 503 aa  288  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  27.49 
 
 		 580 aa  140  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  27.15 
 
 		 551 aa  134  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  24.51 
 
 		 605 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  31.21 
 
 		 532 aa  114  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  25.53 
 
 		 631 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  25.7 
 
 		 585 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  26.12 
 
 		 631 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  23.78 
 
 		 479 aa  94.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  45.19 
 
 		 624 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  45.19 
 
 		 624 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  23.4 
 
 		 580 aa  92.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  43.27 
 
 		 602 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  43.64 
 
 		 568 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  43.93 
 
 		 624 aa  73.6  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  44.76 
 
 		 634 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  44.76 
 
 		 634 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  40.19 
 
 		 575 aa  70.1  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  24.18 
 
 		 678 aa  70.1  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  39.34 
 
 		 715 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  37.6 
 
 		 935 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  36.22 
 
 		 624 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  39.05 
 
 		 595 aa  67.4  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  37.14 
 
 		 602 aa  63.9  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  37.23 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1661  hypothetical protein  22.63 
 
 		 676 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.773537  normal  0.657918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>