41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1380 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 355 aa  728    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  42.25 
 
 		 359 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1790  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.09 
 
 		 387 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.35 
 
 		 365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.35 
 
 		 365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0197424 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  43.45 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.26 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.57 
 
 		 358 aa  295  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.43 
 
 		 359 aa  295  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.44 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.1 
 
 		 365 aa  282  6.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  41.49 
 
 		 367 aa  272  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.74 
 
 		 353 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.56 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  43.09 
 
 		 325 aa  256  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.08 
 
 		 353 aa  256  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2213  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.37 
 
 		 326 aa  199  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.75 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.79 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.83 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  22.14 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3419  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.93 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  22.88 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.69 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.88 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.79 
 
 		 312 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.31 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.53 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 		 248 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.6 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.47 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1015  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.16 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.59 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.83 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2456  hypothetical protein  23.51 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  0.363451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0208  endonuclease/exonuclease/phosphatase  18.69 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.28 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.02 
 
 		 327 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.35 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.41 
 
 		 365 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.163228  normal  0.242955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>