294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1720 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1720  cytochrome c  100 
 
 		 217 aa  448  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2279  cytochrome c  61.14 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  50.72 
 
 		 261 aa  218  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  50.72 
 
 		 257 aa  218  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  53.23 
 
 		 284 aa  215  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  50 
 
 		 239 aa  211  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  47.06 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  49.5 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  47.26 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1242  putative cytochrome c  48.51 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.291072  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  49.73 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  49.18 
 
 		 236 aa  194  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  47.52 
 
 		 283 aa  193  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  49.18 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  49.18 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  48.63 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  48.63 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  49.18 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  44.98 
 
 		 281 aa  190  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  48.56 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  48.53 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  48.53 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  47.55 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  48.31 
 
 		 234 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  49.46 
 
 		 257 aa  184  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  48.31 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  48.31 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  48.31 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  47.8 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  48.31 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  48.31 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  48.31 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  43.96 
 
 		 240 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  48.68 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  47.52 
 
 		 203 aa  174  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  45.85 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  47.75 
 
 		 253 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  44.61 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  44.61 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  44.61 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  36.31 
 
 		 226 aa  104  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  32.04 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  33.91 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  30.17 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  31.76 
 
 		 271 aa  92.8  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  32.95 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  32.43 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  31.58 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  31.58 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  31.61 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  32.57 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  34.3 
 
 		 199 aa  89  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  32.57 
 
 		 216 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  29.14 
 
 		 256 aa  88.6  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  31.21 
 
 		 216 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  31.21 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  37.29 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  35.71 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  32.43 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  32.18 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0670  cytochrome c553  33.52 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.680454  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  33.53 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  33.14 
 
 		 208 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  32.18 
 
 		 208 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  32.18 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  32.18 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  32.18 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  30.41 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  31.4 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  31.46 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  36 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  31.4 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  31.58 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  31.49 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  31.49 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  31.61 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  30.81 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  32.37 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  29.65 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  29.65 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  30.23 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  34.1 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  30.59 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  33.73 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  32.39 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  29.48 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  29.31 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  34.1 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  34.34 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  34.34 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  30.95 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  30.53 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  30.05 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  32 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  32.2 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  30.51 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  31.64 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  30.6 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>