More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1155 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 373 aa  763    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  62.5 
 
 		 368 aa  424  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  56.25 
 
 		 374 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  62.36 
 
 		 367 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  57.91 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  56.02 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  54.86 
 
 		 371 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  56.02 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  56.23 
 
 		 376 aa  408  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  55.14 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  55.14 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  54.86 
 
 		 371 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  58.1 
 
 		 372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  61.25 
 
 		 368 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  54.69 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  54.69 
 
 		 377 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  54.69 
 
 		 377 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  54.69 
 
 		 377 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  54.69 
 
 		 377 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  54.69 
 
 		 377 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  54.69 
 
 		 377 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  53.89 
 
 		 372 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  53.78 
 
 		 371 aa  401  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  54.69 
 
 		 377 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  54.69 
 
 		 377 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  54.42 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  54.42 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  55.07 
 
 		 372 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  53.72 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  53.7 
 
 		 373 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  54.82 
 
 		 377 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 		 377 aa  394  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  54.82 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  54.82 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  54.82 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  54.82 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  54.82 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  52.83 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  55.65 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  54.82 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  52.7 
 
 		 372 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  54.82 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  52.7 
 
 		 372 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  54.82 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  54.82 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  55.4 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  52.05 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  51.48 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  52.43 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  54.55 
 
 		 365 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  56.49 
 
 		 373 aa  381  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  55.25 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  52.29 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  55.91 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  52.35 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  52.07 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  52.02 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  53.74 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  53.72 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  55.74 
 
 		 370 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  55.89 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  55.28 
 
 		 371 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  51.35 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  52.76 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  54.97 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  58.43 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  56.22 
 
 		 373 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  55.46 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  55.37 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  53.57 
 
 		 371 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  54.12 
 
 		 370 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  52.43 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  54.67 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  55.19 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  52.7 
 
 		 371 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  49.31 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0984  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0509355  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  52.04 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  53.24 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  54.95 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2017  alanine dehydrogenase  56.18 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.02834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  53.72 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  54.79 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  51.92 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  54.05 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  52.43 
 
 		 371 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  52.73 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  55.77 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1760  L-alanine dehydrogenase  54.06 
 
 		 363 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  54.92 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  54.95 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  54.95 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  52.14 
 
 		 376 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  52.43 
 
 		 371 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  52.43 
 
 		 371 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5339  alanine dehydrogenase  53.99 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  52.16 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  52.43 
 
 		 371 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  52.43 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  50.82 
 
 		 367 aa  364  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>