40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1755 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  100 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32.19 
 
 		 249 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  33.05 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  31.33 
 
 		 249 aa  135  8e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.34 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.85 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  29.54 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  33.33 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  31.6 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32.27 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32.8 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.27 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.92 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  28.02 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  29.96 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  32 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  26.12 
 
 		 293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  28.75 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.78 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.83 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  25.52 
 
 		 244 aa  95.5  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  28.29 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  25 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  25.42 
 
 		 245 aa  88.6  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  28.92 
 
 		 343 aa  87  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  25.9 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  25.71 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  25.1 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  26.03 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  23.28 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  22.75 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  24.9 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  23.71 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  25 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  24.07 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  24.7 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  23.63 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  22.54 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1463  DNA polymerase sliding clamp  20.59 
 
 		 247 aa  52.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1375  proliferating cell nuclear antigen-like protein protein  19.34 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.148042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>