More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0100 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0100  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  100 
 
 		 429 aa  872    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00378073 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1026  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  47.82 
 
 		 415 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1406  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  46.99 
 
 		 418 aa  350  3e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0450215  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0324  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  46.75 
 
 		 418 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1720  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  44.26 
 
 		 439 aa  344  1e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.744807 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0513  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  46.51 
 
 		 418 aa  344  2e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.970726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0361  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.74 
 
 		 451 aa  344  2e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1370  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  46.97 
 
 		 419 aa  342  9e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.108214  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1002  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  44.39 
 
 		 410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1913  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  42.15 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1221  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.35 
 
 		 417 aa  312  7.999999999999999e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0579  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.72 
 
 		 426 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1224  L-asparaginase, type I  43.1 
 
 		 411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.93 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.731285  normal  0.499768 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0159  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  39.85 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.71 
 
 		 424 aa  299  7e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.365888 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0584  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  40.05 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.26 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0272423  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0577  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.29 
 
 		 411 aa  288  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000010795  decreased coverage  0.000463482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0144  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.75 
 
 		 417 aa  288  2e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0740  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.01 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.486321 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0731  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.7 
 
 		 418 aa  283  6.000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.452449  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1079  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.21 
 
 		 383 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470158  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1652  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.24 
 
 		 423 aa  280  4e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1797  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  39.51 
 
 		 447 aa  279  6e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0649571  normal  0.610323 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0853  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  39.95 
 
 		 409 aa  279  6e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173976  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2973  L-asparaginase, type I  38.5 
 
 		 427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0767547  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2140  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  36.84 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0116186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3159  L-asparaginase  36.95 
 
 		 334 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2884  L-asparaginase  36.66 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2121  L-asparaginase  36.36 
 
 		 334 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3136  L-asparaginase  36.36 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2916  L-asparaginase  35.78 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3137  L-asparaginase  35.78 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3116  L-asparaginase  36.36 
 
 		 334 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2650  L-asparaginase, type I  33.33 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2846  L-asparaginase  35.36 
 
 		 334 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3413  L-asparaginase, type I  32.48 
 
 		 339 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000308602  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0851  L-asparaginase  34.8 
 
 		 341 aa  167  5e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.23635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1900  asparaginase  34.81 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4073  predicted protein  31.59 
 
 		 325 aa  158  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0759  L-asparaginase, type I  30.38 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  31.63 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0303  L-asparaginase, type I  31.87 
 
 		 340 aa  140  4.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  30.3 
 
 		 327 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  28.96 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  30.3 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0247  L-asparaginase, type I  30 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29713  predicted protein  29.07 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.841946  hitchhiker  0.00675888 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27196  predicted protein  29.07 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664269  normal  0.0275025 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02780  L-asparaginase I  30.48 
 
 		 342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419131  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1807  asparaginase  29.53 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0241049  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  30.12 
 
 		 348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0263  L-asparaginase, type I  29.51 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0392514  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2254  cytoplasmic asparaginase I  29.74 
 
 		 338 aa  123  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000486388  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4698  Asparaginase  27.24 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  28.49 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2070  cytoplasmic asparaginase I  30.26 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0395614  hitchhiker  0.000282097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1963  cytoplasmic asparaginase I  30.26 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.145247  normal  0.0808598 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2079  cytoplasmic asparaginase I  29.97 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4846  Asparaginase  25.91 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  29.82 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4329  asparaginase  27.24 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2421  cytoplasmic asparaginase I  30.26 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  28.61 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  28.61 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2233  L-asparaginase, type I  27.75 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.30257 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  30.41 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1280  L-asparaginase, type I  28.57 
 
 		 342 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.223178  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1908  cytoplasmic asparaginase I  29.97 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  hitchhiker  0.0000134735 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2181  Asparaginase/glutaminase  31.21 
 
 		 327 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000581575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  28.32 
 
 		 324 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0542  L-asparaginase, type I  27.71 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000289217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5475  L-asparaginase, type I  28.53 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.241616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  30.8 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1544  cytoplasmic asparaginase I  27.41 
 
 		 349 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  27.65 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2295  cytoplasmic asparaginase I  30.23 
 
 		 337 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000365461  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2412  cytoplasmic asparaginase I  30.58 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031003  hitchhiker  0.000169421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2050  cytoplasmic asparaginase I  30.58 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0327097  hitchhiker  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1218  L-asparaginase  28.02 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000485776  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2054  cytoplasmic asparaginase I  30.58 
 
 		 337 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013597  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  27.65 
 
 		 338 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2584  cytoplasmic asparaginase I  27.75 
 
 		 337 aa  116  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002912  L-asparaginase  30.06 
 
 		 337 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1902  cytoplasmic asparaginase I  29.69 
 
 		 342 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.104501  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2312  cytoplasmic asparaginase I  28.62 
 
 		 337 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000448344  hitchhiker  0.000363201 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1940  cytoplasmic asparaginase I  28.49 
 
 		 337 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.680808  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  27.99 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  27.99 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  27.99 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2121  L-asparaginase  28.9 
 
 		 359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  27.99 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03045  cytoplasmic asparaginase I  29.77 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0883  asparaginase/glutaminase  29.77 
 
 		 334 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.551989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1622  L-asparaginase  28.61 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00318095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1406  L-asparaginase  28.61 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2723  cytoplasmic asparaginase I  28.97 
 
 		 338 aa  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  hitchhiker  0.00370317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1516  L-asparaginase  28.61 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000137409  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4748  L-asparaginase, type II  31.38 
 
 		 356 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>