36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4022 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  76.79 
 
 		 168 aa  247  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  76.19 
 
 		 168 aa  245  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  76.79 
 
 		 168 aa  245  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  74.4 
 
 		 168 aa  243  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  72.02 
 
 		 168 aa  239  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  51.53 
 
 		 168 aa  173  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  50 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  46.39 
 
 		 170 aa  151  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  50.9 
 
 		 170 aa  147  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  46.71 
 
 		 170 aa  147  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  46.11 
 
 		 170 aa  147  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  48.5 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  41.32 
 
 		 182 aa  144  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  47.59 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  49.4 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  40.85 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  40.35 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  39.16 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  40.35 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  39.75 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  37.42 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  34.15 
 
 		 176 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  33.54 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  37.88 
 
 		 197 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  30.67 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  31.45 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  26.97 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  34.51 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  27.46 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  30.89 
 
 		 191 aa  51.2  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  28.12 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7942  predicted protein  29.66 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>