More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3995 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3995  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
417 aa  840    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4315  transposase IS116/IS110/IS902  72.03 
 
 
389 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3060  transposase IS116/IS110/IS902  67.02 
 
 
383 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137931  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.09 
 
 
539 aa  495  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191643  normal  0.811146 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  70.19 
 
 
326 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.69 
 
 
384 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756749  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.92 
 
 
383 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.15 
 
 
366 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  46.22 
 
 
379 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  46.22 
 
 
379 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3938  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.11 
 
 
386 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1954  transposase IS116/IS110/IS902  41.54 
 
 
385 aa  253  6e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2773  transposase IS116/IS110/IS902  41.54 
 
 
385 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  41.24 
 
 
379 aa  229  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  39.1 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  39.1 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  36.29 
 
 
382 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.37 
 
 
288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.26 
 
 
338 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.27 
 
 
499 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.37 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.11 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1575  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.11 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0511159  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.11 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.11 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  28.26 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.32 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.42 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  26.92 
 
 
340 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0488  putative transposase IS116/IS110/IS902  36.36 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296532  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3945  IS110 family transposase  30.8 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4548  IS110 family transposase  30.8 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4956  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.83 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440622  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  28.57 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2266  transposase IS116/IS110/IS902  30.45 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.6 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0894966  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1055  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.91 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.124364  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.4 
 
 
372 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  31.47 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2485  ISPsy7, transposase  29.77 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00294179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3274  ISPsy7, transposase  29.77 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0336107  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  30.37 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.1 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  27.4 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.4 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.4 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.4 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.4 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.4 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0372  ISPsy7, transposase  29.77 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2167  ISPsy7, transposase  29.77 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2465  ISPsy7, transposase  29.77 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3146  ISPsy7, transposase  29.77 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0791519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3325  ISPsy7, transposase  29.77 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0495526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3746  ISPsy7, transposase  29.77 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3800  ISPsy7, transposase  29.77 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5571  ISPsy7, transposase  29.77 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.86 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  25.69 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.38 
 
 
338 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.38 
 
 
338 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.38 
 
 
338 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0377  ISCps1, transposase  26.11 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417861  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.71 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.37 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3079  transposase IS116/IS110/IS902  29.28 
 
 
337 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3085  transposase IS116/IS110/IS902  29.28 
 
 
337 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1652  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00058709  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1591  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000798859  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0124  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332846  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1826  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1231  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1406  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0854  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00143492  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1595  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000374661  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2209  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691177  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1361  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0495  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375707  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1419  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1338  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00487008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0636  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.596694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0668  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0714  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1033  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0155  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.239351  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1835  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2103  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1848  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1976  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1983  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1778  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.459014  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0330  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000188022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1568  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0135752  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1676  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1389  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1715  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1256  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.14 
 
 
338 aa  64.7  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1529  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251179  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1296  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>