More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3647 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  100 
 
 		 315 aa  617  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  61.59 
 
 		 315 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2142  inner-membrane translocator  45.87 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  42.2 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0143  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 311 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 328 aa  185  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 325 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 359 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3398  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 335 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0288037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.37 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  35.1 
 
 		 603 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  33.22 
 
 		 603 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1564  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1100  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0111942  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  31.65 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0801  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  31.79 
 
 		 616 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  28.75 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 345 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5993  putative branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  33.55 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  0.170989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 345 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2007  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.78 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0908  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.579851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 315 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  30.97 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1974  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  34.16 
 
 		 348 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.36 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1929  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 407 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.38 
 
 		 609 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 324 aa  129  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 317 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 415 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1500  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.27 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 562 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0112  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 319 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.82 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.1 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0779  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 336 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0484  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1437  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 368 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 393 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1532  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 368 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.378741  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  30.18 
 
 		 350 aa  122  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  28.83 
 
 		 352 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0863  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.46 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0562534  normal  0.217688 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 407 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  34 
 
 		 614 aa  122  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3011  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152809  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 355 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  33 
 
 		 337 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.66 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.63 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  30.92 
 
 		 358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0361  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 346 aa  119  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  30.64 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.81 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  31.41 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3819  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0794  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1453  inner-membrane translocator  28.83 
 
 		 366 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2554  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 322 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>