46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5478 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5478  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 287 aa  560  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0290  putative integral membrane protein  41.35 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528279  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  36.65 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1678  hypothetical protein  37.74 
 
 		 265 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1586  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03840  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.7 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4838  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120323  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5631  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118129  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3532  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  30.26 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11540  ABC-2 type transporter  29.12 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.608741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  29.12 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  29.03 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.21 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0506  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  31.46 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 231 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1076  ABC transporter membrane protein  29.79 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0598525  normal  0.0512291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 278 aa  45.8  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.04 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  27.13 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.53 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  23.92 
 
 		 924 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1912  ABC-2 type transporter  31.31 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  22.58 
 
 		 911 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  29.5 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  22.58 
 
 		 869 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  22.97 
 
 		 869 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3270  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  22.97 
 
 		 869 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  29.5 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  22.58 
 
 		 923 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  22.58 
 
 		 869 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 252 aa  42.7  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  23.18 
 
 		 1114 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 386 aa  42.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 344 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>