26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4183 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  54.39 
 
 		 1029 aa  916    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 1084 aa  2033    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  47.52 
 
 		 985 aa  761    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  45.49 
 
 		 1043 aa  668    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  50.23 
 
 		 1034 aa  771    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  43.06 
 
 		 1067 aa  565  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  42.92 
 
 		 1030 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1202 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  37.24 
 
 		 1012 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  40.05 
 
 		 1026 aa  382  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  38.78 
 
 		 942 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  36.99 
 
 		 946 aa  347  8e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  36.97 
 
 		 1017 aa  317  7e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  33.19 
 
 		 1315 aa  308  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  33.7 
 
 		 940 aa  277  9e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31370  hypothetical protein  34.24 
 
 		 1082 aa  276  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.114699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  39.21 
 
 		 985 aa  253  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  48.42 
 
 		 1284 aa  214  9e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  34.61 
 
 		 847 aa  177  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1306 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  19.3 
 
 		 1672 aa  60.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2613  hypothetical protein  36.26 
 
 		 412 aa  53.5  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 1687 aa  53.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1474  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1625 aa  51.6  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109086  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1934 aa  50.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5788  transglutaminase domain protein  33.9 
 
 		 2543 aa  45.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>