More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0613 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0613  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 245 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661073  normal  0.951436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  57.78 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5739  dethiobiotin synthase  59.91 
 
 		 242 aa  215  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10780  dethiobiotin synthase  61.67 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7723  dithiobiotin synthetase  58.59 
 
 		 242 aa  211  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3762  dithiobiotin synthetase  60 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8310  Dethiobiotin synthase  59.56 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0968  dithiobiotin synthetase  59.39 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1632  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2973  dethiobiotin synthase  59.52 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109922  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1571  dethiobiotin synthase  51.06 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2000  dethiobiotin synthase  50.68 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1520  dethiobiotin synthase  49.79 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1052  dethiobiotin synthase  47.98 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.802225  normal  0.0589723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0472  dethiobiotin synthase  45.67 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322044 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3412  dethiobiotin synthase  43.93 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2790  dithiobiotin synthetase  48.2 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  45.93 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3627  dithiobiotin synthetase  48.58 
 
 		 226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  38.57 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  38.5 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  39.9 
 
 		 240 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  45 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3076  dithiobiotin synthetase  45.71 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3136  dithiobiotin synthetase  45.71 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3093  dithiobiotin synthetase  45.71 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842884  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  38.1 
 
 		 243 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  39.9 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  38.35 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  39.81 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  38.67 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  43.26 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  35.71 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  34.93 
 
 		 263 aa  95.1  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  34.38 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  33.93 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  33.93 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  35.92 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  35.5 
 
 		 264 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  34.82 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  34.82 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  29.95 
 
 		 646 aa  90.5  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  31.36 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  33.53 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  40.54 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  33.48 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  33.48 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  33.48 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  33.48 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  40.45 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  37.44 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  35.12 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  42.44 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  46.63 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  29.17 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  36.73 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  38.33 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  31.61 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  30.97 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  36.41 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  39.77 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  32.21 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  31.5 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  33.18 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  47.19 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  29.15 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  29.15 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  33.78 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  34.31 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  34.31 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  34.31 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  32.37 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  42.44 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  32.8 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11602  dithiobiotin synthetase  45.74 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000527679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  42.44 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  28.57 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  35.57 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  37.93 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  29.68 
 
 		 190 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  31.73 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  33.82 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  32.11 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  32.87 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  26.92 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  35.89 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  33.82 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  33.82 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  42.13 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  42.13 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  33.82 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  35.32 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  31.68 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  30.69 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  33.82 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1117  dethiobiotin synthase  35.75 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  33.82 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  23.73 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  37.36 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  39.38 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>