44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0460 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  624  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  66.89 
 
 
303 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  56.55 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  49.15 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  49.49 
 
 
299 aa  279  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  48.12 
 
 
301 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  45.39 
 
 
299 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  39.52 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  39.58 
 
 
308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  37.59 
 
 
305 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  37.24 
 
 
305 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  37.24 
 
 
305 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  38.46 
 
 
301 aa  199  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  36.77 
 
 
300 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2944  hypothetical protein  26.9 
 
 
340 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1342  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1719  hypothetical protein  33.17 
 
 
342 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116958  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2861  hypothetical protein  25.48 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5032  hypothetical protein  31.53 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124208  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4846  hypothetical protein  31.88 
 
 
338 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0398901 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4550  hypothetical protein  31.88 
 
 
338 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233569  normal  0.516258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4463  hypothetical protein  31.88 
 
 
338 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1071  hypothetical protein  28.11 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10902  hypothetical protein  26.6 
 
 
340 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1477  hypothetical protein  27.65 
 
 
335 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.305762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2316  hypothetical protein  26.69 
 
 
327 aa  87  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442681  normal  0.270132 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1962  hypothetical protein  28.38 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2323  hypothetical protein  28.38 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1197  hypothetical protein  24.92 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735296  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1563  hypothetical protein  24.28 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.128095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6829  hypothetical protein  28.02 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0696  hypothetical protein  25.4 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0534  hypothetical protein  22.78 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  24.54 
 
 
370 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  21.4 
 
 
369 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  26.06 
 
 
430 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  26.19 
 
 
369 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1069  hypothetical protein  24.14 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  23.36 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  23.03 
 
 
327 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  23.03 
 
 
327 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  22.7 
 
 
327 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  22.37 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  23.36 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  23.83 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>