More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5157 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  47.21 
 
 		 249 aa  228  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  53.12 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  52.04 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  44.44 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.75 
 
 		 240 aa  186  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  46.39 
 
 		 256 aa  185  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  42.06 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  42.11 
 
 		 363 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  40.99 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  39.92 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  44.06 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.06 
 
 		 286 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  49.44 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  40.34 
 
 		 232 aa  169  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  38.14 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  38.14 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  38.14 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  39.6 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  39.6 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  39.6 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  39.6 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  39.11 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  39.81 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  38.91 
 
 		 227 aa  155  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  38.07 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  42.13 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.88 
 
 		 458 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  36.32 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  38.73 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  38.22 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.22 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  38.22 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  38.22 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  38.22 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  38.22 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  37.7 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  39.02 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  37.7 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  37.86 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  40.33 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.5 
 
 		 248 aa  148  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  40.67 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  37.17 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  39.73 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  40.49 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1552  DedA family membrane protein  40.09 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.487737  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  39.22 
 
 		 215 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  41.55 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  36 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.3 
 
 		 201 aa  142  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  35.12 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  37.19 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.33 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  35.41 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  36.95 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  36.59 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  37 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  35.27 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0208  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.27 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  42.58 
 
 		 223 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3854  DedA family transmembrane protein  41.63 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  41.29 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  41.43 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0282  DedA family transmembrane protein  42.58 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0766  DedA family transmembrane protein  42.58 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  43 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.98 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  38.31 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  40.45 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.06 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  34.93 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  37.99 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  37.99 
 
 		 218 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  35.96 
 
 		 222 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  43.35 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  37.13 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  33.92 
 
 		 244 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  35.38 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  36.59 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  38.65 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  35.96 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  38.61 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0735  SNARE associated Golgi protein  41.15 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.633458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  34.67 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  34.67 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  34.67 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  37.89 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  43.24 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  38.42 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  40.69 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  40.69 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  36.63 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  40.69 
 
 		 226 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0661  DedA family transmembrane protein  41.15 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  37.68 
 
 		 215 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  40.69 
 
 		 226 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  40.69 
 
 		 226 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  40.69 
 
 		 226 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  40.69 
 
 		 226 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>