32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4907 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  624  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  50.52 
 
 		 311 aa  282  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  45.94 
 
 		 679 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  42.21 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  43.82 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  38.82 
 
 		 712 aa  198  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  39.18 
 
 		 623 aa  194  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  42.52 
 
 		 713 aa  192  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  33.65 
 
 		 669 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  33.43 
 
 		 455 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  35.11 
 
 		 425 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  34.93 
 
 		 788 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  28.62 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  32.81 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  32.78 
 
 		 351 aa  89.7  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  31.52 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  30.96 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  32.65 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  30.95 
 
 		 322 aa  85.9  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  28.89 
 
 		 334 aa  85.9  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  31.75 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.647344 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  32.05 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  30.4 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  28.91 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  27.34 
 
 		 601 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  29.29 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2734  hypothetical protein  27.96 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000198645  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  25.28 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  30.46 
 
 		 588 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  26.32 
 
 		 693 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  31.61 
 
 		 559 aa  49.7  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>